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聚合酶链反应单链构象多态性和银染技术筛查胰岛素受体基

2022-07-29
来源:求医网
关键词: 多态现象;单链构象;受体;胰岛素;突变;聚合酶链反应

【摘要】目的建立聚合酶链反应单链构象多态性(RCR-SSCP)和银染技术筛查胰岛素受体基因突变方法。方法选择89例非胰岛素依赖型糖尿病患者,PCR扩增编码胰岛素受体酪氨酸激酶域的外显子(外显子17~21),进行SSCP电泳,银染色后,对突变样品进行序列分析。结果发现11例外显子17和1例外显子20的异常电泳条带,外显子17的突变经顺序分析,为CAC1058→CAT1058的杂合和纯合多态性突变。结论PCR-SSCP结合银染技术是一种操作简便、经济、灵敏度高、适合于临床大样本基因突变筛查的方法。

PCR-SSCP and silver staining technique in screening insulin receptor gene mutation NIU Wenyan, SHI Jiandang, ZHANG Wei, et al.Tianjin Medical University, Tianjin 300070

【Abstract】ObjectiveTo establish polymerase chain reaction-single strand conformation polymorphism(PCR-SSCP) and silver staining technique to screen mutation of insulin receptor gene.Methods89 patients with NIDDM were collected.Exon 17-21 of insulin receptor gene were amplified by PCR and screened by SSCP electrophoresis.After silver staining,the mutation samples was sequenced.ResuletsEleven variant sequences in exon 17 and 1 in exon 20 were detected. Direct sequence analysis of exon 17 showed that homozygous and heterozygous nonsense mutations were silent polymorphism at position 1058 (CAC→CAT).ConclusionThe PCR-SSCP combining with silver staining technique is simple, economic, and sensitive.

【Key words】Polymorphism, single-stranded conformationalReceptors, insulinMutationPolymerase chain reaction

1989年Orita等建立的单链构象多态性技术具有简便、灵敏度高等优点,结合非同位素的银染具有灵敏度高、操作简便等优点,受到研究者的青睐。Ⅱ型糖尿病是由多种基因参与致病的代谢性疾病,为探讨胰岛素受体(INS-R)基因在其中所起的作用,我们用PCR-SSCP方法对89例非胰岛素依赖型糖尿病(NIDDM)患者INS-R基因进行了突变筛查。

材料和方法

一、材料

蛋白酶K(德国MERCK公司产品),PCR试剂(Promega公司产品),丙烯酰胺及甲叉双丙烯酰胺(为美国Bio-Rad公司产品)。

研究对象:89例非严重胰岛素抵抗的普通NIDDM患者,选自天津医科大学总医院内分泌科(NIDDM按WHO 1985年诊断标准)。正常对照者无慢性疾病,口服葡萄糖耐量试验(OGTT)正常,血清胰岛素正常,HbA1c<6.1%,血压正常。

二、方法

1.合成寡核苷酸引物:参照Seino等[1]的引物设计。

2.提取外周血DNA:取抗凝外周血3 ml,分离白细胞,应用苯酚-氯仿方法提取DNA,使纯度达到A260/A280,大于1.8。

3.PCR扩增目的基因片段:扩增体系50 μl,用2%琼脂糖凝胶电泳检测扩增产物。

4.SSCP分析:聚丙烯酰胺凝胶浓度为6%~12%,交联度为49∶1,取5 μl PCR产物,加等体积的甲酰胺变性液,98℃变性5分钟后置冰浴,在电压100~300V,温度4℃或20℃条件下,电泳5~20小时(依据不同的外显子采取不同的电泳条件)。

5.银染:电泳结束后,用乙酸固定,纯水洗,银染液染色(1.4g/L AgNO3和甲醛),纯水洗,加显色液(30g/L Na2CO3,甲醛,400 μg/L Na2S2O3)显色,乙酸终止反应,用玻璃纸封好胶片,晾干后长期保存。

6.测序:将SSCP检出的样品用低熔点琼脂糖凝胶电泳纯化后,使用BRL公司测序试剂盒,采用双脱氧末端终止法测序。

结果

1.PCR扩增结果:外显子17-21片段长度分别为317 bp、214 bp、285 bp、208 bp、291 bp。

2.PCR-SSCP分析结果:在89例NIDDM样品中,发现11例外显子17突变,正常对照为A电泳带型,突变分为B、C两种电泳带型(图1)。1例外显子20突变,外显子18、19、21未发现突变。

第2道为正常对照A带型,其余为被检测样品,箭头所示为异常电泳条带,

分为B、C两种,同种带型具有相同的突变。

1胰岛素受体基因外显子17的SSCP电泳结果

3.核酸序列分析结果:外显子17 B、C两种电泳带型各取1例进行序列分析,结果分别为9例、2例CAC1058→CAT1058杂合及纯合多态性突变(图2)。

从左至右为呈现A、B、C三种带型的样品。A为正常对照,

B、C分别为CAC1058→CAT1058纯合及杂合多态性突变。箭头所示为突变碱基。

2胰岛素受体基因外显子17核酸序列分析结果

讨论

一、PCR-SSCP的影响因素

1.PCR产物的高度特异性,是SSCP成功的前提。首先要优化PCR反应条件,以免非特异扩增带干扰结果分析,其次要避免PCR操作过程中的污染。银染聚丙烯酰胺凝胶电泳检测灵敏度比EB高,可检测出在紫外灯下看不到的非特异带。为了排除干扰带的影响,我们首先在紫外灯下大致判断一下PCR产物的量,若样品间产物量相差较大,用TE调整PCR产物的浓度,使样品间近于相同,以防浓度大的样品出现非特异带。其次,在进行SSCP电泳时,在变性样品的泳道旁边点上同样量的未变性的样品,若未变性样品出现一条以上的带,表明有非特异扩增产物,那么对应的变性样品正常单链带附近的条带就可能不是突变带,反之则为突变带。若双链DNA在聚丙烯酰胺凝胶电泳中出现较多的非特异带,干扰了结果分析,可把PCR产物纯化后再进行SSCP分析(此情况一般很少见到)。最后,对于检测出的突变样品,最好换一种浓度的胶再做一次,若还出现异常带,可确定为突变型。

2.凝胶浓度和交联度、电泳温度是影响PCR-SSCP分析的主要因素。由于各个片段的长度不同,且碱基顺序也不同,所以每个片段都要建立一个最适的电泳条件。

聚丙烯酰胺凝胶的浓度和交联度影响单链DNA的泳动速度和对构象的分辨率,为SSCP分析的关键。因此,有时在一种条件下检测不出突变带,而换个条件则能检出突变,所以宜采用2种以上的电泳条件,以提高突变检出率。

甘油的浓度和电泳的温度影响单链DNA的分离,添加适量甘油有利于凝胶分离DNA单链。升高电泳温度,单、双链DNA泳动快,单链带间距离缩短,单双链间距离拉大,降低温度则相反。但降低温度似乎比添加甘油能更好地分离DNA单链。

二、银染的影响因素

银染色时,试剂最好为优级纯,且要用去离子水新鲜配制,显影液预冷、显影时间加长、显影过程中多次更换显影液可使背景变浅,条带清晰。

银染后的凝胶,用玻璃纸封好,晾干后长期保存。

三、INS-R基因与NIDDM

胰岛素受体基因突变与NIDDM INS-R基因位于人的第19号染色体短臂的末端,为单拷贝基因,包括11个内含子和22个外显子。INS-R是一种糖蛋白,有2个α亚基和2个β亚基,α亚基位于细胞膜外,是胰岛素的主要结合部位,β亚基为一跨膜蛋白,其位于胞浆的部分有一段氨基酸序列由外显子17-21编码,称为酪氨酸激酶域,含有多个酪氨酸残基和ATP结合位点,可发生自身磷酸化。胰岛素首先与INS-R的α亚基结合,激活此区域,然后依次磷酸化细胞内的一系列蛋白质和酶,使激素信号在细胞内传递,产生生理效应。若此区域内的某些碱基发生突变,则可能使正常或高于正常水平的胰岛素不能发挥正常的生理效应,造成胰岛素抵抗和糖耐量异常。目前对具有严重胰岛素抵抗NIDDM患者的INS-R基因突变的研究报道较多,基因突变大部分是在这些患者中检测到的[2,3],而对于非严重胰岛素抵抗的NIDDM患者的此类研究还较少。本研究结果为基因错意突变,在普通NIDDM患者中出现的频率较低,由此可以认为INS-R基因突变不是本人群NIDDM发病的主要原因。

总之,PCR-SSCP结合银染技术具有安全、快速、经济、灵敏度高等优点,特别适合于临床大样本基因突变的筛查。胰岛素受体基因突变是普通NIDDM发病的原因之一,但不是主要的致病原因。

参考文献

1Seino S, Seino M, Mell GI. Human insulin receptor gene. Diabetes, 1990,39:123-128.