【摘要】目的建立同时检测Myc基因3个成员L-myc 、N-myc及C-myc异常扩增的简便方法。方法采用聚合酶链反应(PCR)技术,用一对引物同时扩增Myc基因3个成员第2外显子中的高度保守区,扩增产物经非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳及激光扫描。结果此法可以检测Myc基因家族中3个成员的扩增情况。 经检测,正常组织细胞没有Myc基因扩增,32例喉癌组织中47%有L-myc和C-myc扩增,41%有N-myc 扩增,与正常比差异均有显著意义(χ2=6.764,7.609, 5.961;P均<0.05)。C-myc扩增率与用PCR-琼脂糖凝胶电泳检测的结果基本相符(χ2=0.254,P>0.05) 。结论此法对检测肿瘤组织中Myc基因3个成员提供了简易、特异、 无放射污染,并且适于临床应用的、优于PCR-琼脂糖凝胶电泳的方法。
A simple PCR for detecting 3 members of Myc geneQuan Chengshi, Guo Xiaofeng, Liu Ming. Department of Otolaryngology Head and Neck Surgery,First Teaching Hospital, Norman Bethune University of Medical Sciences,Changchun 130021
【Abstract】ObjectiveTo establish a simple method for detecting abnomal amplification of Myc gene family included 3 members(L-myc, N-myc and C-myc) at the same time.MethodOne pair primer was used to amplify the high conservative region in exon 2 of 3 members of Myc gene by PCR.A PCR-PAGE-laser scanning technique was applied.ResultsThere was no amplification of Myc gene in the nomal laryngeal tissues.The amplification of abnormal L-myc and C-myc gene was 47%,and the abnormal N-myc gene was 41% in 32 cases of laryngeal cancer.The C-myc amplification rate coincided with the result of detecting with PCR-agaroe gel electrophoresis(χ2=0.254,P>0.614).ConclusionThis method is free from radiactive pollution. It is better than the traditional way of PCR-agarose gel eleatrophoresis test and is useful in detecting 3 members of the Myc gene.
【Keywords】Genes, mycPolymerase chain reactionLaryngeal neoplasms
至今Myc基因已被发现了至少3种,C-myc、N-myc和L-myc[1,2],3者在第2外显子中有2个区域高度同源,3个基因分别表达各自独立的蛋白,它们的生理作用基本一致。研究表明,在许多肿瘤细胞中有Myc基因扩增或异常表达,但在不同的肿瘤组织和癌细胞系中,Myc基因家族的成员在扩增或表达方面有些差异。因此,深入研究Myc基因3个成员与人类肿瘤的关系非常有意义。本研究建立的PCR-非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳-激光扫描技术,可同时检测肿瘤组织中3种Myc基因的扩增情况,在肿瘤发生发展过程中,为进行3种基因各自作用机理的研究提供了简易的实验手段。
材料及方法
一、材料
1.标本:32例喉癌组织取自我院耳鼻咽喉科住院病人,7例正常喉组织取自我科同期住院的非癌症病人,3例正常白细胞取自我院血库人全血。所有标本均经病理证实。根据喉癌组织病理分化程度不同,分为高、中、低分化癌。
2.PCR引物:5′-CCCAGCGAGACATCTGGAAGAA-3′,5′-GAGAAGCCGCTCCACATGCAGTC-3′。扩增Myc基因家族的3个基因,即C-myc(244 bp),N-myc(230 bp),L-myc(227 bp),由上海复旦大学遗传学研究所合成。
3.试剂:TaqDNA聚合酶、dNTP为Promega公司产品;蛋白酶K为Merke公司产品;硝酸银为沈阳试剂二厂产品;Marker PUC 18质粒DNA HeaⅢ酶切片段为Sigma公司产品。
二、方法
1.模板DNA提取:参照参考文献[3]方法进行。
2.PCR扩增:PCR扩增总反应体积50 μl,应用模板DNA 50 ng,在DNA扩增仪操作(Perkin Elmer Cetus),循环周期为94℃1分钟,55℃1分钟,72℃2分钟,经过30个循环后,补加72℃7分钟。
3.琼脂糖凝胶电泳步骤:取PCR产物5 μl加1μl上样缓冲液(0.25%溴酚蓝,0.25%二甲苯氰FF,40%蔗糖水溶液)之后备用。制备2%琼脂糖凝胶倒入水平式电泳槽中。待胶凝固后加样,用1×TAE缓冲液作为电极缓冲液,溴化乙锭染色,电压低于5V/cm,时间约为2小时。电泳结束后,凝胶直接在紫外透射仪上观察结果。照像,拍片后的底片在激光扫描仪上进行扫描。
4.非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳步骤:取PCR产物5 μg加1 μl上样缓冲液之后备用。制备8%非变性聚丙烯酰胺凝胶,灌注于20 cm×20 cm×0. 1 cm垂直板电泳槽中, 待凝胶聚合后加样,用1×TBE缓冲液作电极缓冲液,室温下电泳1瓦特约14小时,待指示剂溴酚蓝移到边缘时停止电泳。将电泳后的凝胶移至方盘中进行硝酸银染色。染色过程如下:用双蒸馏水(dH2O)洗凝胶3次后浸泡于染色液(硝酸银1g,加dH2O至500 ml)中30分钟,去掉染色液,用dH2O漂洗3次凝胶,然后浸泡于显色液(NaOH15g,38%甲醛3.8 ml,加dH2O至500ml)中约10分钟,当显出棕黑色DNA区带时,用dH2O洗1次凝胶后,浸于停影液(冰醋酸25 ml,加水至500 ml)中约30分钟,然后把凝胶移至固定液(乙醇25 ml,冰醋酸2.5 ml加dH2O至500 ml)中固定。固定后的凝胶在看片灯上观察结果、拍照片,凝胶直接在激光扫描仪进行扫描。
结果
1.PCR-琼脂糖凝胶电泳结果:实验设计的引物扩增Myc 3种基因,经PCR扩增,喉癌组织及正常组织细胞DNA在琼脂糖凝胶上均可见2条小于300 bp 的电泳带。第1条带为N-myc( 230bp)和L-myc(227 bp)2个DNA片段合成带,因两者只相差3 bp,故琼脂糖凝胶电泳不能将其分开而呈现1条带;第2条电泳带为C-myc基因(244 bp)。 将电泳结果拍照后的底片在激光扫描仪进行扫描,得出2条带的峰面积值。正常组织细胞的C-myc带比N-myc和L-myc合成带密度弱,比值小于1,求出正常组织细胞的C×(N+L)-1均值为0.6 。
C-myc扩增倍数=喉癌的C×(N+L)-1×0.6-1,考虑实验中的综合因素,定为1.5倍以上有C-myc扩增。结果显示:喉癌中有42%的C-myc扩增,正常组织细胞没有C-myc的扩增。
2.PCR-中性聚丙烯酰胺凝胶电泳结果:由于中性聚丙烯酰胺凝胶电泳对DNA的分离特性,经PCR扩增后的Myc基因电泳带显示3条。第1条带为L-myc(227 bp),第2条为N-myc(230 bp),第3条为C-myc(244 bp) 。将扩增出特异性Myc基因电泳带的凝胶片,直接在激光扫描仪上进行扫描,得出3条带的峰面积值。然后用各自的峰面积值除以各自的碱基数,作为该基因的单拷贝数,将L-myc、N-myc和C-myc三者中最小的单拷贝数设定为1,比较其他2个基因的相对倍数。正常组织细胞L-myc∶N-myc∶C-myc均值为1.0∶2.2∶3.8。结果32例喉癌中47%有L-myc和C-myc的扩增,41%有N-myc扩增。C-myc的扩增率与用PCR-琼脂糖凝胶电泳检测的结果基本一致(χ2=0.254,P>0.614)。
讨论
目前,国内外用于检测N-myc、L-myc及C-myc的方法大多采用各种杂交技术[4,5]。由于应用放射性同位素,需要各种防护措施,不安全又复杂,且一次只能检测Myc基因家族中的一个基因,临床上很难常规应用。PCR-琼脂糖凝胶电泳技术简单、易行、快速,但由于灵敏度低,不能分开只相差3个bpDNA的L-myc和N-myc,所以只能检测C-myc的相对扩增,而不能检测N-myc或L-myc扩增或二者的同时扩增。而且,如果有N-myc或L-myc扩增或二者同时扩增时,即使有C-myc扩增,也会出现假阴性结果。我们首先把PCR技术与中性聚丙烯酰胺凝胶电泳及激光扫描技术结合起来,并用硝酸银试剂使凝胶上的Myc 基因双链染成黑褐色。这样的实验结果特异性高,方法简单,成本低,又避免了放射性同位素的一切弊端,很适合于临床应用。聚丙烯酰胺凝胶电泳分辨率高于琼脂糖凝胶电泳,具备分离只相差一个核苷酸的不同DNA片段的特性。在中性聚丙烯酰胺凝胶中,双链DNA片段的电泳迁移率主要由DNA片段长短决定,而与其碱基组成和顺序基本无关。基于以上原理,我们设计了此实验,目的是能把琼脂糖凝胶电泳上没有分开的只相差3 bp的N-myc和L-myc分开,作到一次可同时检测3种Myc基因的扩增情况。实验表明:用PCR-中性聚丙烯酰胺凝胶电泳和用PCR-琼脂糖凝胶电泳检测C-myc基因结果基本相符, 说明本研究建立的方法结果可靠。Myc基因是较早发现的一组癌基因,Myc基因的异常扩增或表达,参与了很多肿瘤的发生和发展。本研究方法对进行3种Myc基因在肿瘤形成过程中作用机理的研究,提供了简便易行的实验手段。
作者单位:130021 长春,白求恩医科大学第一临床学院耳鼻咽喉-头颈外科
参考文献
1Schwab M, Varmus HE, Bishop JM.Human N-myc gene contributes to neoplasformation of mammalian cells in culture. Natur, 1985,316:160-162.
2Nau MM,Brooks BJ,Battey J, et al. L-myc,a new myc related gene amplified and expressed in human small cell lung cancer. Natur, 1985,318
