一、材料与方法
1.10例肺癌患者活检组织、配对外周血由长治医学院附属医院肿瘤科提供。按常规方法提取癌组织及配对外周血DNA。
2.PCR引物及条件:P53基因第5外显子上游引物P5A为:5′-GGATCCTTCCTCTTCCTGCAGTACTCCCCT-3′;下游引物P5B为:5′-GAATTCGCCCAGCTGCTCAC-CATCGCTATC-3′。第6外显子上游引物P6A为:5′-GGATCCCACTGGTTGCTCTTAG-GTCTG-3′;下游引物P6B为:5′-GAATTC-AGTTGCAAACCAGACCTGAGG-3′。第7 外显子上游引物P7A为5′-GGATCCAGTGTTACCTCCTCGGTTGGTTCT-3′;下游引物P7B为:5′-GAATTCACAAGTGGCTCCT-CACCTGGAGTC-3′。第8外显子上游引物P8A为:5′-GGATCCCCTATCCTGAGTG-GTAATCTA-3′;下游引物P8B为:5′-GAATTCTCCTGCTTGCTTACCTCGCTTAGT-3′。扩增条件为:50 μl PCR反应体系中含KCl,MgCl2,dNTP,Tris*HCl,pH 8.0,引物各0.4 μmol/L,模板DNA 0.2 μg,1.5 uTaqDNA多聚酶。阴性对照用蒸馏水取代模板DNA。以1.5%普通琼脂糖凝胶检测扩增产物。
3.SSCP及银染:取5 μl PCR产物与等量加样缓冲液混匀,95℃变性3分钟后立即置冰上,取3~4 μl相同的样本在A、B二种条件下进行。A条件下凝胶中含5%甘油,B条件下凝胶中不含甘油,其他条件均为:9%非变性聚丙烯酰胺凝胶(丙烯酰胺:甲叉双丙烯酰胺=49∶1),0.5×TBE作电泳缓冲液,恒流10 mA,同一室温下电泳6小时。电泳结束后,取下凝胶进行银染显色。
nD:非变性DNA,B:外周血,T:癌组织,→示异常电泳带,下图同
图15例肺癌样本P53基因第5外显子SSCP检测结果
图22例肺癌样本P53基因第8外显子SSCP检测结果
二、结果与讨论
在A条件下,2,3,8,9号癌组织样本和在B条件下,2,8,9号癌组织样本同样在P53基因外显子5上出现了异常电泳带(图1)。另外,4号癌组织样本在P53基因外显子8上出现了异常电泳带(图2)。
对SSCP结果的判定主要依据癌组织样本中出现与自身正常组织不同的DNA电泳带。因取材关系,实际中因多种因素的影响,出现的DNA带往往多于或少于该理论值。一般认为凝胶中加入甘油能稳定DNA单链构象,因而易于发现因点突变造成的异常电泳带,主张凝胶中加入5%或10%甘油。我们发现2,8,9号样本在两种条件下均能检测到P53基因突变,但3号样本只能在有甘油时才能检测到,4号样本只能在无甘油时才能检测到。这2种条件下分别检测到P53基因突变的频率均为40%。若采用2种条件进行SSCP,则检测到P53基因突变的频率可达50%。进一步对结果分析还可以看出,2,9号样本在A,B条件下电泳异常带均易识别;但8号样本在A条件下异常电泳带易识别得多。在不含甘油和5%甘油的凝胶中进行PCR-SSCP分析,我们认为可提高SSCP技术的准确性与敏感性。
(收稿:1998-01-09修回:1998-04-16)
