摘要 目的:鉴定导致中国人遗传性高铁血红蛋白血症(RCM)的NADH-细胞色素b5还原酶(b5R)基因突变类型,探讨RCM发病的分子基础。方法:逆转录-聚合酶链反应产物直接测序和cDNA克隆测序分析先证者的b5R编码基因;限制性酶切分析其基因组DNA。结果:发现一例RCM患者b5R基因第72密码子存在新的错义突变(CTC→CCC)。结论:该突变导致b5R蛋白第72位亮氨酸被脯氨酸替换(L72P)是该先证者致病的分子基础;进一步证实Ⅰ型RCM患者的b5R基因突变多发生在近5′端部分。
Leu 72 Pro mutation in the NADH-cytochrome b5 reductase gene found in a
chinese hereditary methemoglobinemia patient Wu Yushui, Huang changhui,
zhu Zhongyong, et al.Center for Medical Laboratory, Fuzhou Military General
hospital, Fuzhou 350001
Abstract Objective: To characterize the mutation in NADH-cytochrome b5
reductase gene in a Chinese hereditary methemoglobinemia patient, and elucidate
the molecular basis of the disease.Methods: b5R gene from a propositus was
analyzed by sequencing the RT-PCR products as well as cDNA clones; and the results
were further confirmed by restriction enzyme analysis of the genomic DNA fragments.
Results: A novel mutation was found at codon 72 of b5R gene from the propositus.
Conclusion: Replacement of Leu with Pro at codon 72 of b5R gene is the molecular
basis of the propositus; and the mutant allele located in 5′ part of b5R gene
mainly cause hereditary methemoglobinemia type I.
Key words Hereditary methemoglobinemiaCytochrome b5 reductasePolymerase
chain reactionGene mutation
人NADH-细胞色素b5还原酶(b5R)基因长31kb,含9个外显子和8个内含子;cDNA长1974bp[1,2]。寻找和分析b5R的基因突变类型,有助于研究该酶结构与功能的关系,从基因水平探究常染色体隐性遗传性高铁血红蛋白血症(RCM)的发病机制,并为建立RCM基因诊断方法检测人群中的杂合子携带者、遗传咨询和优生优育乃至基因治疗等提供必要条件。我们用聚合酶链反应(PCR)相关技术及分子克隆和序列测定,分析福州市郊县一RCM家系先证者的
b5R基因,发现了一个新的错义突变。
病例和方法
1 先证者 女,3岁。足月产,发育正常。父母非近亲婚配。出生后数月发现患儿颜面部发绀,尤以口唇为甚,无明显诱因。其兄(5岁)亦有类似症状。无活动后蹲踞现象。超声心动图和心肺各项检查未见异常。精神神经系统检查未见异常。血气分析示低氧血症。Hegesh改良法检测b5R活性为0.10U(正常对照2.30±0.31U);高铁血红蛋白含量占全部血红蛋白的15%。血红蛋白分析未见异常。临床诊断:遗传性高铁血红蛋白血症Ⅰ型。入院后给予维生素
c治疗,全身发绀明显减轻。
2 主要试剂与仪器 RNA提取试剂盒及DNA测序试剂盒(Promage公司产品);反转录试剂盒(Gibco公司产品),Taq酶(Sangon公司产品),γ-32P-ATP(北京亚辉生物工程公司产品),内切酶EcoR Ⅰ、BamH Ⅰ、Apa Ⅰ和DNA分子量参照物购自华美公司;T4 dNA连接酶购自NewEngland Biolab公司。PE2400 DNA扩增仪、荧光自动DNA序列分析仪(美国PE公司产品)、手工测序装置(Bio-Rad公司产品)。
3 方法
3.1 逆转录半巢式PCR:外周血白细胞总RNA的提取和cDNA第一链的合成按各自试剂盒说明书进行。自行设计扩增b5R cDNA全部编码序列(900bp)的外引物(由Sangon公司合成):P1(上游)
5′GGGAATTCATGGGGGACCCAGCTCAGCACG3′
p2(下游)
5′GGGGATCCCCTCAGAAGACGAAGCAGCGC3′内引物:
P3(下游)5′GATGACCAGGTCCACGAAAGC3′
P4(上游)5′GAGAATTCGAGAGCCCGGACATCAAG3′以逆转录合成的cDNA (1.0μl)为模板,先用外引物P1/P2(各15 pmol)、5.0mmol dNTP、
2.5μl10×PCR缓冲液、1UTaq聚合酶在25μl反应体积中作PCR扩增;反应结束后,取1.0μl产物分别用引物P1/P3和P2/P4行半巢式PCR的第二轮扩增。两轮循环反应条件均为:94℃30秒,60℃30秒,72℃45秒,共30个循环。最终反应产物经普通琼脂糖凝胶电泳纯化回收。3.2 PCR产物直接测序:P1和P3末端标记γ-32P-ATP后,分别作测序引物,对P1/P3半巢式扩增产物进行手工测序(按说明书操作)。
3.3 PCR产物克隆测序:纯化回收后的引物P2/P4半巢式PCR扩增产物及噬菌体载体M13mp18分别用EcoR Ⅰ、BamH Ⅰ双酶切,用连接酶连接过夜(16℃)。常规氯化钙法转化大肠杆菌JM109。重组子鉴定、单链抽提等按文献[3]方法。以正常人及先证者部分b5RcDNA阳性克隆的噬菌体单链为模板,荧光标记的M13通用引物进行全自动DNA序列分析。
3.4 基因组DNA片段的扩增及限制性酶切分析:为进一步证实该突变的存在并建立简便的基因诊断方法,常规方法提取患儿及正常人外周血白细胞基因组DNA。扩增b5R第3、第4外显子的引物序列及扩增条件参见文献[4]。PCR产物经乙醇沉淀、洗涤后用ApaⅠ酶切,8%聚丙烯酰胺凝胶电泳分析。
结果
1 PCR产物直接测序 P1/P3半巢式扩增产物(长338bp)测序结果显示,与正常人比较,先证患儿b5R第72密码子(位于外显子3)以脯氨酸(CCC)替换了正常的亮氨酸(CTC)(见图1)。
与正常人b5R编码基因比较,先证者基因的第72位密码子的改变为CTC→CCC(结果所示为编码链)
图1 b5R cDNA部分序列分析结果
2 PCR产物克隆测序 P2/P4半巢式扩增产物(长817bp)克隆后的测序结果证实,与正常人b5R cDNA序列(结果未显示)比较,先证患儿b5R基因第72密码子存在CTC→CCC突变,而第4外显子以及下游序列未见其它突变(见图2)。
先证者基因的第72位密码子改变为CTC→CCC(结果所示为反义链)
图2 先证者b5R cDNA经半巢式PCR扩增的产物克隆后全自动序列分析结果
3 限制性酶切分析 用引物P5/P6扩增出长1120bp的基因组DNA片段。由于第72密码子突变后导致该位点产生一个Apa Ⅰ酶切位点(5′GGGCC↓C3′),使酶切片段改变(见图3)。正常为471,649bp;先证患儿为440,31,649bp。确证先证患儿b5R基因存在新的突变(CTC→CCC)。
a:正常对照;B:先证患儿;M:分子量标记
图3 限制性酶切分析b5R基因组DNA的PCR扩增片段
讨 论
已报道的Ⅰ型RCM的b5R基因突变均为发生在外显子的错义突变[5]。所以,我们以细胞总RNA经逆转录合成cDNA,以此为模板进行PCR扩增及序列分析,可迅速有效地检出编码基因的突变。
迄今已发现13种不同的突变位点可导致Ⅰ型和Ⅱ型RCM。国内仅我们报道过一种与日本学者报道相同的突变类型[6]。RCM Ⅰ型患者b5R缺陷仅见于红细胞,临床表现较轻,以全身发绀为主。Ⅱ型患者全身细胞均存在b5R缺陷;临床表现除发绀外,还有致死性的精神发育迟缓及神经系统紊乱等[7]。寻找和分析b5R的基因突变类型,有助于揭示单一基因发生的突变引起不同临床表型的分子机制。从目前的研究结果看,Ⅰ型RCM患者的b5R基因突变位点大多近基因的5′端(仅1例例外),而Ⅱ型患者该基因突变位点大多近3′端。前者导致突变酶的稳定性降低;后者往往导致突变酶的稳定性和催化活性都大大降低[5]。我们的研究结果也证实了这一结论。经对正常人和患儿的b5R基因这一位点碱基序列的反复测定及限制性酶切分析,排除正常多态性和PCR错配的可能性,确证了患儿b5R
