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病因主要有以下几方面：
1.VD缺乏 VD的缺乏和不足是引起佝偻病的主要原因。幼龄动物大多在户外饲养，体内 VD主要从母乳中获得，依靠自己的皮肤制造的VD是很少的。断乳后如果饲料中VD供给不足，导致钙、磷吸收障碍，这时即使饲料中有充足的钙、磷，亦会发生佝偻病。母乳中VD不足，或用代乳的饲喂时，或母禽产蛋期VD缺乏，蛋中VD不足，可产生先天性和后天性VD缺乏所致佝偻病。
2.钙、磷不足或两者都缺乏，或二者比例严重失调，都可造成佝偻病 一般情况下，只要有足够量的VD，上述钙、磷含量和比例稍有偏差时，不会造成佝偻病。只有同时伴有VD缺乏，或VD处于临界生理需要时，上述钙、磷营养稍有偏差，幼畜生长较快时，则可发生佝偻病。
3.断奶过早导致消化不良或患胃肠疾病虽然能摄食到足够的钙、磷和VD，但不能被机体吸收和利用。长期腹泻，尤其是患肝、肾疾病时，致使VD在肝、肾内羟化转变作用丧失，造成具有生理活性的 1，25-(OH)2VD3的缺乏而致病。饲料中蛋白质缺乏或过剩，微量元素铜、碘、锰的不足或相反锶、钡含量过多时，以及内分泌(甲状腺素、胸腺)机能障碍，都能影响钙、磷代谢和VD的吸收和利用，亦可促进佝偻病的发生。
4.先天性佝偻病 指由于妊娠畜体内矿物质缺乏或不足和阳光照射不充足。冬季钙、磷或V。缺乏或不足，影响胎儿的生长发育，致幼畜出生后，即表现骨钙化不良的症状。
