如上面所述，复杂的感染可以分为难治感染和由于宿主原因使治疗失败率增加的感染。对复杂的尿路感染必须诊断明确，因为它关系到以后的治疗方案。具备什么因素可以诊断为复杂的尿路噶不然呢?这些因素包括器质性或功能性病变、宿主反应和有毒病菌引起的易感性。

复杂尿路感染的发病机制和简单的尿路感染的发病机制不同。

如果一个患者可以在门诊进行治疗，那么氟哌酸应该作为一线药物被选择，如果一个患者有多种感染，这是要应用挂广谱抗生素进行治疗。通常抗生素至少要应用14到21天。每个人的不同情况将会在以下章节中详述。

梗阻

病例：一个既往有肾结石的32岁妇女出现了右侧腰部疼痛和发热。

草酸钙解释可以引起尿路阻塞和以后复发，除了结石病、肿瘤、凝块都可以引起尿路阻塞。

尿酸杆菌引起的粪石

病例：一个25岁的女孩，尿路感染反复发作，最近因为尿路感染服用抗生素进行治疗，现在经过治疗她已经没有症状了。P.mirabilis导致尿液碱化，引起钙盐、镁盐、氨基盐及磷酸盐沉积最终导致结石形成。这些结石最终形成鹿角形结石堵塞集合系统而被发现。结石的形成于细菌的持续感染有关，一旦停用抗菌药物，菌尿就马上出现，粪石通常含钙量少，在泌尿系平片上不显影。

泌尿系畸形

病例：一个18岁的女孩，尿路感染反复发作，肾盂输尿管连接处狭窄。

对于那些具有结构异常和尿路感染的患者，他们的症状只有在手术后才能够消失，这些异常包括双输尿管畸形、憩室、输尿管囊肿、先天的无功能肾。

怀孕

病例：一个29岁的怀孕女孩，在她怀孕的第九个月出现发热，有腰部疼痛、恶心、呕吐。

虽然已经证实孕妇的细菌感染和非孕妇的是相似的，但怀孕妇女的急性肾盂肾炎的发病率比非怀孕者高。这可能是由于在怀孕期间尿路许多解剖和生理的变化造成的，急性肾盂肾炎更容易在怀孕的6-9月出现。

在抗菌药问世以前，患有肾盂肾炎的孕妇的婴儿早产和围产期死亡率有逐年上升的趋势。今天，在学术界，仍有关于妊娠期肾盂肾炎是否会引起早产和围生期死亡的辩论。不论在什么样的情况下，孕期患肾盂肾炎的患者应该得到马上的确诊和治疗。哌尼西林、呋喃妥因类抗生素在孕期应用是安全的。但是呋喃妥因不能用来治疗肾盂肾炎，因为它不能达到足够的治疗浓度。应避免应用对发育期的胎儿产生副作用的药物进行治疗。氟哌酸可能会损害软骨的发育。TMP-SMX在孕期后三个月能引起胎儿血胆红素过多。治疗以后，就不需要再巩固治疗了，因为那样会增加肾盂肾炎复发的危险性。

糖尿病

病例：一个患有糖尿病的45岁妇女因为急性肾盂肾炎而入院，虽然应用抗生素治疗3天，但仍高热不退。

糖尿病患者的尿路感染发病率要比非糖尿病者高，治疗起来比较困难，因为抗生素很难达到理想的药物浓度。糖尿病还会引起好多其他的并发症，这在本章不再详述。

脊椎外伤

病例：一个27岁的女孩既往曾有过脊椎外伤，现在出现发热及尿液异味，自诉以前曾进行过导尿处理。

对这类病人膀胱的处理作用很大。留置导尿或耻骨上膀胱造瘘术的患者感染的发病率很高。留置导尿术从1972年开始应用于脊椎外伤的患者。事实证明这种方法能通过减少钙盐沉积和静脉受压来降低尿路感染的发生率。但是尿路感染对于一个脊椎外伤的人来说是一个非常常见但又很难确诊的问题。因为感觉丧失，患者不会有典型的尿频、尿急、尿痛症状。另外，这些患者通常会有菌尿和脓尿，从而忽略了感染的存在。因此，诊断主要依据背部、腹部或者膀胱区不适.导尿管漏尿、发热、抽搐、感冒和有异味的尿液，在治疗之前必须要进行尿液培养，因为极有可能有细菌抵抗作用。脊椎外伤伴尿路感染的患者应该进行泌尿系影像学检查、尿液测定及对膀胱病变进行评估。