1质粒DNA
在立克次体族中目前证明仅有贝氏柯克斯体携带有质粒。至今已发现的质粒有4种,它们分别为:(1)QpH1,首先由Samuel等[2]等自九里株Ⅰ相分离,大小为36kb,每个细胞中有3个拷贝。已用限制性核酸内切酶SalⅠ、KpnⅠ、PstⅠ及XbaⅠ构建出QpH1的限制酶切图谱。此质粒并不伴随相变异而丢失,与人类急性Q热有关的分离株常含有QpH1质粒。(2)QpRS,分离自慢性心内膜炎病人及流产山羊胎盘。内切酶分析显示QpRS比QpH1大2~3kb,含有独特的DNA序列。有的慢性病人分离株分离不出质粒,可能由于QpRS质粒序列已整合到染色体DNA中[3,4]。Savinelli[5]等用QpRS自无质粒的Ko株染色体DNA基因文库中筛选出阳性克隆,杂交分析证实Ko株的染色体DNA与QpRS具有同源性。(3)QpDG,由野生啮齿动物分离株分离,大小为45kb。带有此质粒的柯克斯体株对豚鼠不致病,对人是否有致病性尚不清楚[6]。(4)QpDV,由Kazar等分离自肺炎患者和牛奶中,大小为33.5kb。急性和慢性Q热分离株中都见有此质粒[7]。
所有质粒的DNA大部分是保守的,共有约30kb的“核心”区,含有50%的质粒DNA信息。除了共同区域外,每种质粒又各有其特异序列。质粒的功能尚不十分清楚,有人根据它与临床表现的关系,推测其特异序列可能编码株特异性毒力因子。如QpRS质粒特有的cbbE'基因只存在于慢性分离株的质粒中[8,9],其它Q热分离株的染色体DNA和质粒(QpH1,QpDG)均未发现。cbbE'基因的ORF长1485bp,编码55kDa的E'蛋白。E'蛋白含495个氨基酸,可能存在于柯克斯体外膜,其功能尚不清楚。而cbhE'为急性Q热分离株的QpH1质粒特有[10],其ORF长1022bp,编码的cbhE'蛋白含341个氨基酸,分子量约为39kDa,成熟的cbhE'蛋白在柯克斯体的胞质中。近年来PCR分析证明,cbhE'基因可为柯克斯体的急、慢性分离株所共有,提示其质粒的类型与Q热的临床类型无关。
2贝氏柯克斯体基因
据文献报道,迄今为止已分离的贝氏柯克斯体基因达十多种。根据功能可分为编码代谢及调节有关酶的基因,与毒力相关的基因,编码免疫保护性抗原的基因。
2.1编码代谢及调节有关酶的基因
2.1.1gltA基因[11,12]枸橼酸合成酶(gltA)基因是第一个在大肠杆菌中克隆和表达的贝氏柯克斯体基因。它编码的46kDa的多肽与其它细菌的枸橼酸合成酶单体的分子量相符。gltA基因带有自身启动子,其ORF长1290bp。枸橼酸合成酶是三羧酸循环中的第一个酶,催化乙酰辅酶CoA与草酰乙酸缩合生成柠檬酸,在生物合成和能量生成中起重要作用。贝氏柯克斯体枸橼酸合成酶基因演绎的氨基酸顺序与G-菌的“大”型酶同源性更高,但其酶活性却与G菌和真核细胞的“小”型酶相似,受4mM ATP的抑制,而不受4mM a-酮戊二酸的影响。
2.1.2pyrB基因[13]天冬氨酸转氨基甲酰酶(ATCase)是嘧啶核苷酸合成过程中一个重要的调节酶,它可催化L-天冬氨酸和氨甲酰磷酸转变成氨甲酰天冬氨酸和磷酸,氨甲酰天冬氨酸进一步环化形成嘧啶环。此途径的终产物UTP和CTP是核苷酸生物合成的基质。
ATCase由pyrB基因编码,细菌中此酶活性受ATP活化而受CTP抑制。柯克斯体的pyrB基因位于一7kb的EcoR Ⅰ DNA酶切片段内,其ORF长954bp,编码含310个氨基酸的多肽,它可能为一个操纵元的一部分。
大肠杆菌的ATCase由6个调节多肽和6个催化多肽组成,2个催化三聚体与3个调节二聚体相连。而柯克斯体的ATCase是三聚体,不含调节多肽。柯克斯体与大肠杆菌、枯草杆菌的pyrB基因的核苷酸同源性分别为44%、50%,而ATCase的催化部分氨基酸序列在这三种亲缘关系较远的微生物中具有高度同源性,提示ATCase的催化机制是相同的。
2.1.3Sdh基因簇[14]琥珀酸脱氢酶是催化琥珀酸脱氢生成延胡索酸的内膜结合酶复合物,由细胞色素b556(SdhC)、疏水蛋白(SdhD)、黄素蛋白(SdhA)和铁硫蛋白(SdhB)组成。柯克斯体SdhCDAB与gltA基因紧密相邻,以相反方向阅读。SdhC靠gltA最近,长375nt,然后依次是SdhD(339nt)、SdhA(长1761nt,编码587个氨基酸的蛋白)、SdhB(705nt)。另外编码α-酮戊二酸的基因sucA始于sdh终止密码下游24p,柯克斯体和E.coli的与三羧酸循环相关的基因在排列上相似,但二者的基因间距有所不同。
贝氏柯克斯体的sdh基因簇是以多顺反子转录的,它受sdhC上游单一启动子调控,可在大肠杆菌中功能性表达。
2.2与毒力有关的基因
2.2.1sod基因[15]吞噬细胞产生的超氧离子(O2-)对细菌有杀伤作用,而超氧化物歧化酶(SOD)可通过将(O2-)转变成过氧化氢而去除其毒性作用,因此SOD在某些细菌的致病性中可作为毒力因子。
Heinzen等用PCR方法直接从柯克斯体中扩增出编码超氧化物歧化酶的基因sod。sod基因的ORF长579bp,编码含193个氨基酸、分子量约23kDa的蛋白。柯克斯体SOD的氨基酸顺序与大肠杆菌的FeSOD同源性最高,并能在大肠杆菌中功能性表达。
2.2.2qrsA基因[16]在感染过程中,柯克斯体可表达酸性磷酸酶(ACP)活性作为毒力因子。在沙门氏菌中,编码ACP的基因的表达受一对基因phoQ和phoP的调节,这对基因为二元调节系统的同源物。二元调节系统可调节多种细菌一系列的胞内过程,且该系统编码的传感蛋白在C端高度保守。根据这一特点,Mo等在柯克斯体中筛选出编码传感蛋白的基因qrsA。qrsA的ORF长1275bp,编码425个氨基酸、分子量42kDa的蛋白QrsA。QrsA与CpxA、PhoR和PhoQ等传感蛋白有显著同源性,其亲水位点与CpxA的非常相似。传感蛋白家族在多种细菌环境适应性中发挥重要作用,对柯克斯体qrsA基因的研究可帮助了解其在感染过程中如何适应胞外环境的变化。
2.2.3Cbmip基因[17]肺炎军团杆菌可产生24kDa的表面蛋白Mip(吞噬细胞感染增强因子),此蛋白在肺炎军团菌的毒力中起重要作用。Mo等克隆了柯克斯体中这一基因,其编码的蛋白能与抗肺炎军团菌Mip的特异抗体反应,此基因称为Cbmip。Cbmip位于一1.7kb的EcoR Ⅰ Cla Ⅰ片段内,有自身启动子,编码含230个氨基酸、分子量25.5kDa的蛋白。氨基酸序列与军团菌和衣原体中的Mip或类Mip蛋白的同源性分别为46%和30%,因此可认为Cbmip编码的是Mip类似物。CbMip是否位于细胞表面尚不清楚,它可能在功能上与军团菌和肺炎衣原体的Mip相类似,在柯克斯体的致病中起作用。
2.2.4dnaJ基因[18]柯克斯体的dnaJ基因存在于一2kb的EcoRⅠ-Hind Ⅲ酶切DNA片段上,基因的核苷酸序列已经测出。柯克斯体的dnaJ基因可在大肠杆菌中表达,产物能与抗大肠杆菌DnaJ蛋白的多克隆抗体发生反应。
大肠杆菌中的dnaJ基因编码42kDa的热休克蛋白DnaJ。DnaJ和DnaK、GrpE热休克蛋白一起与细胞分裂、RNA和DNA合成、蛋白折叠和分泌、噬菌体λ和P1的复制、热休克反应的调节以及鞭毛合成有关。温度调节在病原菌毒力基因的表达中发挥重要作用,柯克斯体dnaJ基因的克隆、测序和表达,将有助于了解温度调控基因的表达。
2.2.5mucZ基因[19]将柯克斯体基因组DNA的一个1.2kb EcoR Ⅰ片段克隆到一多拷贝质粒中,可诱导大肠杆菌荚膜合成(粘液化)。核酸序列分析显示有一长810bp的ORF,可编码含270个氨基酸的蛋白,由于它能诱导粘液化(mucoidy),将此基因称作mucZ。在mucZ基因单一的Nru Ⅰ限制酶切点插入一tet盒子可使其诱导粘液化的能力丧失。MucZ蛋白的C末端与DnaJ蛋白的J区及其同源物具有同源性,提示MucZ和DnaK-chaperon系统的组分间有相互作用。大肠杆菌lon-RcsA介导的荚膜合成需DnaK热休克系统,而MucZ诱导荚膜合成不依赖于lon-RcsA,而是通过二元调节因子RcsC和RcsB的作用,另外还需DnaK和GrpE而不需DnaJ。故推测MucZ是类DnaJ chaperone蛋白,在有活性的RcsA-RcsB复合物形成和RcsB依赖RcsC的磷酸化中是必需的。
荚膜合成可帮助某些病原菌逃避宿主吞噬细胞的吞噬,是一种重要的毒力因子,但是柯克斯体尚未发现有荚膜形成。
2.2.6rnc操纵元[20]大肠杆菌中rnc操纵元由三个结构基因rnc、era、rec0构成,rnc基因编码的RNase Ⅲ为双链RNA依赖的RNA内切酶,带有mRNA转录子的RNase Ⅲ可活化或抑制基因表达;Era蛋白为大肠杆菌生存所必需;rec0基因产物与基因重组和修复有关。
柯克斯体的rnc操纵元位于一3.2kb的EcoR Ⅰ 片段上,与构成大肠杆菌rnc位点的三个结构基因具<
