应用套式PCR从一例维吾尔族丙型肝炎病毒(HCV)感染者血清〔职业献血员，有多次献血史，无自觉肝炎症状，抗-HCV(＋)，PCR基因分型为Ⅰ/Ⅱ/Ⅲ混合型〕中，扩增出C区部分基因片段(357bp)，将其克隆于T载体中进行基因型分析，并对不同基因型的C区片段进行序列测定。随机挑取15个阳性克隆，进行HCV PCR基因型分析，结果其中有1株Ⅰ型，13株Ⅱ型，1株Ⅲ型。说明在一个Ⅰ/Ⅱ/Ⅲ混合型HCV感染者体内，三种不同基因型的HCV病毒滴度是不同的，存在以Ⅱ型HCV为主的“优势基因型”。将这15个HCV C区部分基因克隆的序列，和我国Ⅱ型HCV株(HPCGENOM)序列比较，发现均有一些碱基发生突变，其突变显示一定规律性，其中有8株在426位发生T→C突变，14株在498位有G→A突变，9株在540位有A→T突变，8株在564位有G→A突变，11株在573位有T→C突变，10株在601位有T→A突变，有14株在633位C→A突变、658位A→T突变、685位T→C突变，在15株序列中244个突变位点中，G→A的突变占20.9%(51/244)，为一主要突变形式，其次T→C的突变占18.9%(46/244)，T→A的突变占12.3%(30/244)，A→T的突变占11.5%(28/244)。在HCV基因库中，比较了Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ型不同株与所测核苷酸序列相同位置的同源性，库中的Ⅰ型株之间为98.5%以上，Ⅱ型株之间97.00%以上(而新近发现的Ⅱ/1c亚型与已报道的Ⅱ型株只有88%～90%同源性)，Ⅲ型株之间98.00%以上。Ⅰ型与Ⅱ型、Ⅲ型之间同源性分别为90%～93%、80%～82%，Ⅱ型与Ⅲ型之间同源性为83%左右。对所测的13个Ⅱ型株基因序列进行比较发现，其中有6株序列完全一样。可见，在此混合型HCV感染者体内，不仅存在以Ⅱ型HCV为主的“优势基因型”，还存在同一基因序列HCV为主的“优势序列”。
基因的高度异质性，或者说多个病毒变种组成的某个病毒群，通常称之为“相似株”(quasispecies)。一般认为“相似株”现象由于病毒基因复制过程中突变和宿主免疫力交互作用的结果。近来，这一概念已广泛用于HIV、HCV在人群中的分布研究，并用此概念来解释为何象HIV、HCV这类病毒常能逃脱宿主免疫继续在体内生存的问题。对15个阳性克隆进行HCV基因型分析显示：Ⅱ型克隆数最多，Ⅲ型其次，Ⅰ型最少。说明在一个混合型HCV感染者体内确实存在“优势基因型”，也就是说，在该例新疆维族HCV Ⅰ/Ⅱ/Ⅲ型混合感染者体内，HCV Ⅱ型是“优势基因型”，HCV Ⅰ型的病毒滴度是很低的，这与宏观上新疆维族人群以Ⅱ型HCV分布为主是相吻合的。同时，在随机挑选的13个HCV Ⅱ型克隆中，有6个(占46.2%)的基因序列是相同的，证明确实有“优势序列”存在。研究HCV的“相似株”、“相似株”中的“优势株”以及“优势基因型”及“优势序列”，对于研究HCV的变异规律、不同基因型HCV的免疫应答规律，进而
本课题由中国人民解放军总后勤部卫生部“九五”指令项目资助
(收稿：1998-12-04)
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