PREPARATION OF A RNA PROBE FOR HUMAN
TYROSINE HYDROXYLASE
Li Shuting, Yang HuiΔ, Zhang Jinlu, Cai Qing, Xun Qunyuan
(Beijing Institute for Neuroscience,Capital University of Medical Sciences,Beijing)
【Abstract】 Objective To prepare a digoxingen-labelled cRNA probe for human tyrosine hydroxylase(hTH2).Methods Using molecular cloning techniques the recombinant plasmid pGEMTH2 was constructed.According to analysis of restriction endonucleases,the pGEMTH2 contained the DNA fragment of hTH2 gene and inserting sit preparation was correct for cRNA-probe.From recombinant plasmid pGEMTH2 prepared cRNA probe was identified by dot blot hybridization.Results The dot blot hybridization showed that the positive reaction sites were purple-blue.Conclusion This probe prepared in present study was sensitive and reliable.This probe might provide a tool for identifying the effect of gene therapy in animal model of Parkinson disease.
【Key words】 Human tyrosine hydroxylase; pGEMTH2; Dig-labeled RNA probes; Dot blot hybridization
在基因治疗帕金森病(Parkinsion disease,PD)的实验研究中,人们应用再生成左旋多巴(L-dopa)和多巴胺(dopamine,DA)这一生化反应中起关键作用的限速酶——酪氨酸羟化酶(tyrosine hydroxylase,TH)基因,做为目的基因所进行的一系列的研究取得了一些进展[1,2]。但是,这些研究多局限于大鼠模型,灵长类动物模型基因治疗的研究工作还刚刚开始。针对目前正在进行的基因治疗PD灵长类模型实验研究中,应用原位杂交方法检测TH基因的体内表达水平的需要,合成可靠和实用性强的人THRNA探针应有重要实用意义。
材料和方法
1. 质粒pGEMTH2的重组
方法主要参照《分子克隆实验指南》[3]
将质粒pGEM-3zf(华美公司)和质粒phTH2(美国Somatix Therapy Corporation)分别用限制性内切酶EcoRI在37℃下消化1h,得到线性化的质粒pGEM-3zf和不同的DNA片段;对酶切后的DNA片段行1%琼脂糖凝胶(上海生化试剂公司进口分装)电泳并取下来自质粒pGEM-3zf的3.199kb片段和来自质粒phTH2的1.832kb片段;用GENE-CLEAN药盒(BIO 101)对其进行纯化,即先将切割下来的带有DNA片段的琼脂糖凝胶在50℃溶解于NaI中,以GLASSMILK吸附溶液中DNA,用缓冲液冲洗3次去除杂质后,再将DNA在50℃溶解于水中得到纯化的3.199kb和1.832kb的DNA片段。然后将3.199kb片段在50℃条件下进行去磷酸化反应(1h),经常规抽提后溶解于水中,得到去除磷酸化的3.199kb DNA片段;将上述纯化的1.832kb DNA片段和去磷酸化后的3.199kb的DNA片段按等摩尔浓度混合。加入T4连接酶(PROMEGA) 3个单位在16℃条件下行连接反应16h;以CaCl2法将大肠杆菌XL-1 Blue制备成感受态细胞,加入经连接反应后的混合物冰浴45min,再通过热休克法使DNA进入感受态细胞;将这些细胞悬浮培养在LB(PROMEGA)培养液中,37℃,1h,然后铺在含氨苄青霉素(AMP,5g/L)的LB琼脂培养基上,37℃,16h,共得到63个菌落。
在培养基上随机取12个菌落,分别置入含有5 ml LB和AMP的12支长试管(20 ml)中进行悬浮培养(37℃,16h);用煮沸法小量从细菌中提取质粒;将培养物离心收获细菌,重悬于STET中,加入溶菌酶(10g/L),混匀后于100℃水浴中加热40s以裂解细菌;离心收集富含DNA质粒的上清液并用常规方法进行沉淀,将12个试管中提取的质粒DNA用限制性内切酶EcoRI消化(37℃,1h)在1%琼脂糖凝胶上进行电泳,以确定拟构建的质粒是否符合设计要求。
经确定为pGEMTH2质粒后,用碱裂解法大量制备这些质粒,即将100ml菌液离心沉淀,收集出细菌重悬于溶液I(50mmol/L葡萄糖,250mmol/L Tris pH8.0,10mmol/L EDTA pH8.0,溶菌酶10g/L)中,加入溶液Ⅱ(0.2mol/L NaOH,1% SDS)和溶液Ⅲ(3mol/L醋酸钾)裂解细菌;离心收集富含质粒DNA的上清,酚/氯仿抽提,去除蛋白杂质,常规方法沉淀DNA,这样,100ml菌液可得到300μg pGEMTH2质粒。
2. RNA探针的制备
将上述所制备的pGEMTH2质粒用限制性内切酶XhoI在37℃温度下进行消化,用GENECLEAN药盒纯化,收集TH基因片段;对此片段在绝对无RNA酶的条件下用地高辛RNA标记药盒进行转录标记反应(总体积20μl,37℃,2h),反应体系中含10mmol/L DTT,RNA酶抑制剂20U,ATP,CTP,GTP各1mmol/L, UTP 0.65mmol/L及有地高辛标记的UTP 0.35mmol/L,1.0μg的人TH线性DNA模板和30U的RNA聚合酶37℃ 2h。用限制性内切酶SmaI 25℃消化30min,然后用pH8.0的EDTA 20mmol/L终止反应,加1/10体积的4mol/L LiCl和3倍体积的无水乙醇,在-70℃下,30min沉淀探针,用75%冷乙醇洗涤2次,最后溶解于DEPC处理过的水中,加入RNA酶抑制剂(10IU/L)分装于小试管中,在-80℃下储存。
3. 地高辛标记探针的杂交与检测
参照文献[3]进行斑点杂交。
先将含有探针序列的质粒pGEMTH2和phTH2加热变性,用DEPC处理过的水进行稀释(稀释浓度为1g/L,0.1g/L和0.01g/L),然后将稀释的DNA按不同浓度梯度点于尼龙膜上,固定DNA,将膜置于80℃,2h。进行预杂交42℃摇动2h,预杂交液中含有0.75mol/L NaCl,0.1%N-十二烷基肌氨酸,0.02%SDS和1%BSA。在上述体系中加入人TH RNA地高辛标记探针(10μg/ml)进行杂交,在42℃摇动16h,杂交后依次用2×SSC和0.1×SSC洗涤各15min,再用缓冲液洗涤1次。缓冲液中含有0.15mol/L NaCl,100mmol/L Tris-HCl(pH7.5)。用3%BSA封闭非特异性抗原,加地高辛抗体(1∶5 000)室温下温育2h,洗涤后用NBT-BCIP室温显色10min。
结果
1. 构建质粒pGEMTH2
技术路线见图1。
质粒pGEM-3zf在限制性内切酶EcoRI消化后经分离纯化、去磷酸化得到线状3.199kb片段,质粒phTH2也经相同限制性内切酶处理并经分离纯化得到1.832kb片段。这些片段在1%琼脂糖凝胶上清晰可见,将上述DNA片段进行亚克隆后随机取12个克隆小量提取质粒。它们经限制性内切酶EcoRI消化并行电泳分析后,证明重组质粒除5号外全部带有插入的TH基因(图2)经限制性内切酶PstI分别对其中4个质粒进行插入方向鉴定,用XbaI进行重复鉴定结果均证明含正、反插入方向各占50%(图3)。
2. RNA探针制备
质粒pGEMTH2经限制性内切酶XhoI消化,用GENECLEAN药盒纯化后得到线状TH模板DNA(图4)。上述线性模板DNA片段用地高辛RNA标记药盒进行RNA探针的逆转录,标记合成反应,得到反应产物即探针,探针总长度经计算为1.404kb。合成反应后经用限制性内切酶SamI消化分别得到0.230kb、0.691kb、0.314kb和0.175kb混合探针。
图1pGEMTH2构建途径
Fig.1 The way of subcloning pGEMTH2 plasmid
图2重组后pGEMTH2 12个克隆,经EcoRI消化后的电泳结果。A.λ dNA/EcoRI,Hind Ⅲ DNA marker; B.2~13为1~12号pGEMTH2/EcoRI样品DNA;1%琼脂糖凝胶,电压50V,1h
Fig.2 The electrophoresis of pGEMTH2 from 12 Subclones digested by EcoRI.A,λDNA/EcoRI,HindⅢ DNA marker; B,2-13 indicate different samples of pGEMTH2/EcoRI from No.1 to No.121% agarose gel,Voltage 50V,1hour
图3pGEMTH2的9~12号样品在Pst I和XbaI分别消化后的电泳结果。9、10为正向插入,11、12为反向插入1~4为XbaI消化后的9~12号样品;5.λ dNA/EcoRI
