应用RT-nested-PCR方法从山东省4例HCV抗体阳性血清中成功地扩增出了C区基因的一个片段(432bp),对其进行了TA克隆及测序,并通过DNASeq软件和GeneBank进行了序列分析和系统发生树分析。对得到的4个山东省HCV分离株C区432bp的核苷酸序列与GeneBank里所有的HCV分离株的序列进行了比较,结果表明其中3个分离株SHD-1、SHD-2和SHD-3与基因型1b的HCV分离株同源性最高,与多个1b型分离株的相应序列核苷酸同源性在95%以上,与典型的1b型分离株HPC1B1的同源性分别为96.752%、97.216%、97.680%,与中国河北株HPCCGENOM的同源性分别为96.752%、96.752%、97.680%,而与中国北京株HCU63376的同源性则高达98%以上,其推导的氨基酸同源性为(94.444~97.619)%。由此可见此3个分离株属HCV1b基因型。而另一分离株SHD-4与典型的2a型分离株HCCOPRP的同源性为96.919%,与同属于2a型的日本株HPCHCJ5同源性为96.682%,其推导的氨基酸同源性皆为97.619%,则应将其归为2a型。本研究首次证明了1b和2a为山东省HCV流行株的基因型,且1b>2a,与我国大部分地区HCV的流行情况一致,填补了山东省在该项研究领域的空白,并为进一步开展HCV感染的病原学、流行病学、临床诊断和治疗及疫苗的研制等提供了依据。
本课题为山东省科委基金资助 ( 编号:961226722)
(收稿:1998-11-19修回:1999-01-07)
