中国图书分类号Q785
Cloning and identification of rBPI23 gene(BPI600 bp)
KE Yan,AN Yun-Qing
(Department of Microbiology and Immunology, Capital University of Medical Sciences,Beijing 100054)
YANG Gui-Zhen
(Department of Immunology, Bethune University of Medical Sciences,Changchun 130021)
AbstractObjective:To clone and identify BPI600 bp gene which encode rBPI23.Methods:The gene which encode rBPI23 were amplified by RT-PCR from mRNA that were extracted from HL-60.Recombinant cloning vector was constructed sequenced after the enzyme digestion.Results:①Prospective amplified products-BPI600 bp gene was obtained by RT-PCR method.②PUC18-BPI180、PUC18-BPI420 cloning vector were successfully constructed,and the enzyme digestion analysis are identical with prospective results.③Sequences are identical with those of the report.Conclusion:PUC18-BPI180、PUC18-BPI420 cloning vector were successfully constructed,and BPI600 bp gene sequences are identical with those of the report.
Key wordsRecombinant bactericidal/permeability increasing protein-23 (rBPI23)PUC18 cloning vectorRT-PCR
革兰氏阴性细菌(G-菌)感染引发的败血症及其休克在临床有很高的死亡率,细菌脂多糖是感染过程中造成多器官功能衰竭和休克死亡的重要始动因子。因此,探求一种既能杀灭G-菌又能中和细菌脂多糖毒性效应的疗法,成为当今抗G-菌感染研究的热点之一[1]。近年来作为宿主天然防御组成成分的抗菌蛋白或多肽正受到人们的极大关注[2]。杀菌/渗透增强蛋白(Bactericidal/permeability increasing protein,BPI)是正常存在于人和其它哺乳动物多形核白细胞中的一种阳离子抗菌蛋白。研究表明,重组BPI(rBPI55)或其功能性氨基端片段(rBPI23)与天然BPI(nBPI55)具有完全相同的生物学作用,它们不仅能广谱杀伤G-菌,还能有效中和细菌内毒素。但药物动力学研究发现,它们在体内的半衰期太短<1 h)[3],因而影响其临床疗效。为此我们提出本项课题研究,拟制备一种由BPI23与IgG Fc嵌合而成的重组蛋白,以期获得一种兼备BPI生物学活性和Ig血清半衰期较长等特性的新型抗菌生物制剂。本文主要介绍该课题研究的前期工作,即BPI23重组蛋白基因克隆和鉴定。
1材料与方法
1.1细胞、菌株和质粒载体HL-60细胞为本实验室保存细胞株;E.coli DH5α(基因型 supE44▲lacU169(Φ80lacI M15)hsdR17 recAl end A1 gyrA96 thi-1 reA1)为本实验室保存菌株;克隆载体PUC18质粒购自北方同正生物工程公司。
1.2主要试剂限制性内切酶(EcoRI、HindIII、PstI)购自Promega公司;T4DNA连接酶购自GIBCO/BRL公司;Taq plusI DNA聚合酶购自Sangon生物工程公司;mRNA提取试剂盒、一步法RT-PCR试剂盒、质粒提取纯化试剂盒购自Promega公司;DNA回收纯化试剂盒购自原平皓生物制品公司。
1.3引物设计与合成根据已知人BPI基因序列,设计合成1对引物:P1 5’CAGAATTCATGGTCAACCCTGGCGTCGTG3’;P2 5’GCAAGCTTCTATTTTGGTCATTACTGGCAG3’。5’端引物P1不含N端信号肽序列,含有EcoRI酶切位点和起始密码子ATG;3’端引物P2含有HindIII酶切位点。该对引物所扩增的基因为编码BPI N端1~199个氨基酸的基因。上述引物均由上海生工生物工程公司合成。
1.4mRNA的提取按mRNA提取试剂盒说明从HL-60细胞中提取mRNA。①取对数生长期HL-60细胞悬液1.2 ml,置于1.5 ml Eppendorf管中1 000 r/min离心10 min 弃上清,保留沉淀细胞。②用手指弹松离心沉淀的细胞,加入40 μl细胞裂解液轻轻吹打,使细胞溶解,再加入80 μl mRNA提取液I,振动混匀,14 000 r/min离心5 min。③取上清至预分装20 μl mRNA提取液II(含连接poly U的树脂)的薄壁PCR管中混匀,70℃保温2 min后降至室温(18℃~25℃),静置10 min(每3~5 min振动混匀2~3次),使mRNA上的poly A与树脂上连接poly U充分结合。④8 000 r/min离心2 min后弃去上清,用200 μl mRNA洗涤液吹打洗涤沉淀物,8 000 r/min离心2 min弃上清。同法洗涤4次后,加入10 μl mRNA保存液振动混匀备用。
1.5RT-PCR扩增获得目的基因按一步法RT-PCR试剂盒说明进行。逆转录反应体系由mRNA保存液10 μl、反应液I 13 μl(5×RT-PCR缓冲液5 μl、25 mmol/L MgSO4 1.5 μl、去离子水6.5 μl)、反应液II 1.5 μl(10 mmol/L dNTP 0.5 μl、引物1 μl、混合酶1 μl AMV逆转录酶0.5 μl、Taq plus I DNA多聚酶0.5 μl)组成。反应程序:48℃逆转录45 min,94℃变性2 min后进行40个PCR循环。循环参数:94℃变性30 s,53.5℃复性40 s,72℃延伸45 s,末次循环后再延伸5 min。
取扩增产物在1.5%琼脂糖凝胶中电泳。根据分子量Marker标示,从琼脂糖凝胶上切下含目的基因(BPI600 bpDNA片段)的凝胶,按DNA快速纯化回收试剂盒操作步骤纯化回收扩增产物。
1.6PUC18-BPI180、PUC18-BPI420、重组克隆载体的构建、筛选和鉴定用EcoRI和HindIII对扩增产物BPI600 bpDNA片段进行双酶切获得BPI180 bp和BPI420 bp2个DNA片段。同时用EcoRI和EcoRI/HindIII分别对PUC18质粒进行酶切反应,前者(EcoRI酶切产物)经去磷酸化处理后,通过连接反应与BPI180 bp基因片段结合构成PUC18-BPI180重组克隆载体;后者(EcoRI/HindIII酶切产物)通过连接反应与BPI420 bp基因片段结合构成PUC18-BPI420重组克隆载体。上述重组克隆载体转化E.coli DH5α感受态细胞,通过蓝白斑筛选获得阳性克隆菌。小量提取质粒后,用EcoRI/HindIII和EcoRI/PstI分别酶切PUC18-BPI420重组克隆载体进行酶切分析和酶谱鉴定。以上各步均参照文献[4]进行。
1.7DNA序列分析从阳性克隆菌中小量提取质粒DNA,以M13 Reverse primer为引物进行全自动测序(由北京赛百盛生物工程公司测定)。
2结果
2.1RT-PCR扩增产物的鉴定RT-PCR扩增产物经琼脂糖凝胶电泳显示,在分子量约600 bp处呈现1条与预期产物分子量大小相符的DNA条带(图1)。PCR扩增产物经EcoRI/HindIII酶切后进行琼脂糖凝胶电泳,在分子量约420 bp和180 bp处呈现2条与预期酶切产物分子量大小相符的DNA条带(图2)。
图1RT-PCR产物
Fig.1Products from RT-PCR
Note:1.pBR332 DNA/MspI marker;2.BPI600 bp from RT-PCR
图2BPI600 bp酶切产物
Fig.2Product of BPI600 bp by enzyme digestion
Note:1.pBR322 DNA/MspI marker;2.BPI600 bp by EcoRI/HindIII digestion(180 bp/420 bp)
2.2PUC18-BPI180、PUC18-BPI240重组克隆载体的筛选和鉴定通过蓝白斑筛选获得阳性克隆菌,小量提取质粒后经酶切和酶谱分析发现:①PUC18-BPI180重组克隆载体经EcoRI酶切后获得1个分子量约180 bp的基因片段;经PstI酶切后获得1个分子量约145 bp的基因片段(图3)。②PUC18-BPI420重组克隆载体经EcoRI/HindIII酶切后获得1个分子量约420 bp的基因片段;经EcoRI/PstI酶切后获得1个分子量约230 bp的基因片段(图4)。上述各酶切片段与预期结果相符,表明BPI180 bp、BPI420 bp已分别整合插入到PUC18相应酶切位点之间。
