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小鼠2-5A合成酶cDNA克隆及全序列测定

2022-07-29
来源:求医网
摘要:通过饲喂放线菌酮,提取小鼠肝脏的总RNA,反转录合成cDNA第一链,利用RT-PCR扩增出1100bp大小的片段,将其克隆入载体pBluescript,采取双链质粒直接测序,获得的序列与国外报道小鼠2-5A合成酶基因序列具99.8%的同源性。氨基酸序列分析表明,小鼠2-5A合成酶与人2-5A合成酶具68%同源性,并在其C端发现亲水基团和糖基化位点。

分类号:Q78文献标识码:A

文章编号:1003-5125(2000)01-0073-05

Molecular Cloning and Sequencing of

Murine 2-5A Synthetase cDNA

PENG Ri-he, YAO Quan-hong, HUANG Xiao-min,FAN Hui-qing, ZHANG Da-bing, JIANG Lin

(Institute of Plant Protection in Shanghai Academy of Agricu ltural Science, Shanghai Key Laboratory of Genetics and Breeding, Shanghai 201106, China)

Abstract:The 2-5 oligoadenylate system provides a universal response in mammals. 2-5A synthetase polymerizes ATP to a series of 2-5 oligoadenylate (2-5A). 2-5A activates a latent endoribonuclease (RNase L) which degrades viral RNA. In this paper the result of cloning and sequencing of the murine 2-5 oligoadenylate gene was reported. There are three different points between the nu cleotide sequence of the cloned murine 2-5 oligoadenylate gene.The amino acid homology of murine 2-5A synthetase with human 2-5A synthetase was 68%. The C- terminal portion of murine 2-5 A synthetase containes a hydrophilic region and a possible glycosylationsite.

Key wordsMurine; 2-5A synthetase; Cloning; Sequence analysis▲

在哺乳动物体内,干扰素具有广泛的生物功能,它能抗癌,抗病毒,对细胞分裂、分化、细 胞膜的透性以及免疫系统都有影响[1]。当细胞受到病毒侵染后,诱导产生干扰素 ,干扰素刺激细胞诱生多种抑制mRNA翻译的酶类,其中2-5A合成酶和RNAase L 与干扰素的 关 系最为密切[2]。2-5A合成酶只有在dsRNA存在下才具有活性,它催化由ATP合成2 ′-5′寡聚腺苷酸(2-5A),2-5A再激活细胞内的RNAase L,从而降解病毒和细胞内的RNA s[3,4]

我们根据小鼠2-5A合成酶基因序列设计引物[5],利用RT-PCR方法,从小鼠的肝 脏中扩增并克隆该基因,采用双链DNA荧光法测定了其序列。

1材料和方法

1.1质粒、菌种

宿主菌DH5α、质粒pBluescript为本室所保存。

1.2化学试剂和酶类

反转录酶、限制性内切酶、Klenow酶、T4DNA连接酶、质粒纯化柱为Promega公司产品,DNA 聚合酶Tag PlusⅡ购自加拿大Sangon公司,DNA序列测定试剂盒为美国ABI公司产品,其它主 要化学试剂为美国Sigma公司或国产AR级试剂。PCR引物由中国科学院上海植物生理所合成。

1.3总RNA的提取

昆明种10周龄雌性小鼠,体重为25~30g,每只饲喂80μg/mL的放线菌酮约50μL,同 时在皮下注射人α干扰素(IFNα2b)1000 IU,2h后,取肝脏放置研钵中边加液氮边研细, 直至粉末状,总RNA的提取采用异硫氰酸胍-苯酚-氯仿抽提法[6]

1.4基因PCR扩增

以总RNA为模板,Oligo(dT)为引物,参照Promega公司cDNA合成产品说明。在AMV反转录酶作 用下合成cDNA第一链后,以此为模板进行PCR扩增,两端引物分别为:

5′端: AAAGGATCCAACAATGGCGCACGGACTCAGGAG

3′端: AAAGAGCTCTTACAGCAGGATACATGTCC

扩增条件为94℃变性40s,57℃退火90s,72℃延伸120s,共进行30个循环。

1.5DNA序列分析

采取双链质粒直接测序方法,双脱氧核苷酸终止法测定序列。用ABI PRISM Dye Terminator DNA测序试剂盒,用Promega质粒纯化柱提纯质粒,在ABI 373型DNA自动化荧光测序仪上进 行双链DNA序列测定。

2结果

2.1PCR产物鉴定及克隆

PCR产物用1%的琼脂糖凝胶电泳检查,扩增片段大小约为1100bp(图1),剩余产物经酚∶ 氯 仿(1∶1)提抽,乙醇沉淀回收后,Klenow酶补平,pBluescript载体EcoR V酶切,两片段连 接,转化DH5α,获带2-5A合成酶基因的克隆(图2)。

图1RT-PCR扩增2-5A合成酶 基因电泳鉴定

Fig.1 Agarose gel electrophoresis of 2-5A

synthetase amplified by RT-PCR

L: Murine liver tissue M: λ DNA EcoRI/HindⅢ

图2重组质粒的 酶切鉴定

Fig.2 Identification of recombinant plasmid

digested by restriction enonuclease

L: recombinant plasmid M: λ DNA EcoRI/HindⅢ

2.22-5A合成酶cDNA序列

结果见图3,共测出小鼠2-5A合成酶基因1100bp。结果显示,基因编码区序列与国外报 导的序列存在三处差异(11:A→C; 227:G→A;1068:T→C)。同源性达99.8%。另外在A TG前面引入植物最佳翻译序列AACA。

图3小鼠2-5A合成酶基因核苷酸 序列

Fig.3 The nucleotide sequence of the murine 2-5A synthetase

2.3小鼠2-5A合成酶一级结构分析

图4为小鼠2-5A合成酶(P25A)和人2-5A合成酶(E16)[7](PHU25A)一级结构分析。 比较发现,它们的氨基酸序列同源性为68%,其中N端都含有三个保守区域(13~25; 58~83 ; 199~225),N端与2′-5′ADP、NTP和dsRNA结合有关,但是两种2-5A合成酶的C端的差 异很大,人2-5A合成酶(E16)C端(346~363)为疏水区域,而小鼠2-5A合成酶C端含有一个 亲 水区域(Glu-Gln-Val-Glu-Glu) (356~361),此外小鼠2-5A合成酶C还有一个糖基化 位点 (Asn-Trp-Thr) (362~364),可能与该酶在体内的半衰期有关。

图4小鼠2-5A合成酶(P25A)和人2 -5A合成酶(PHU25A)氨基酸序列比较

Fig.4 The differences of amino acids between murine 2-5A synthetase (P25A) and human 2-5A synthetase (PHU25A)

3讨论

干扰素诱导哺乳动物对病毒的抗性,其机制尚未完全阐明。但是已经验证2-5A合成酶系统 在调节细胞内RNA代谢以及抵抗外源病毒侵染方面起着关键作用。2-5A合成酶系统是一个诱 导系统,只有在双链RNA存在的情况下,该系统才有功能。

尽管植物体内是否存在2-5A合成酶系统还不能肯定,然而Truve用小鼠2-5A合成酶基 因转 化马铃薯,转化植株获得了对TMV、PVX等多种病毒的免疫抗性[8]。植物病毒多为 单股正链RNA病毒,在其复制过程中都要经过双链RNA阶段,因而利用2-5A合成酶系统转化 植物可望获得广谱抗病毒植株。和其它植物抗病毒基因工程策略不同,2-5A合成酶系统不 是来源于植物或病毒本身,抗病毒植物不容易退化,另外非常低水平的病毒复制就可以诱导 植物细胞死亡,从而不利于病毒的传播[9]。我们将2-5A合成酶基因5′端突变, 加上植物最佳翻译序列AACA,并构建了该基因的植物表达系统,进一步的转化工作正在进行 ,希望最终能用于多种蔬菜和花卉的抗病毒品种的选育。■

基金项目:上海市科委资助项目,编号96JG05075

作者简介:彭日荷(1969-),男,汉族,江西省泰和县,副研究员,硕士学位。主要从事植物基因克隆及表达调控研究。

参考文献:

[1]刘新垣.干扰素的功能表达机制[J].国外医学分子生物学分册,19