中图分类号:Q754文献标识码:A文章编号:0379-4172(2000)05-0455-07
The Function of T7 Promoter as cis-Acting Elements for
Polymerase II in Eukaryotic Cell
LI YueQinZHU JiaMingLI HongJianXIE WeiBingZHOU TianHong
(Department of Biotechnology Jinan University, Guangzhou 510632, China)
WANG TongGe
(Affiliated Hospital of Jinan University Medical College, Guangzhou 510630, China)
Abstract:Using the chlorampheniol acetyltransterase gene as reporter, the function of phage T7 promoter in mammalian cells was studied by inhibition of transcription with α-amanitin. The experiment proved that the reporter under T7 promoter was transcribed by RNA polymerase II. Competitive electropho retic mobility shift assay (CEMSA) with TATA box, CAAT box, GC box and octamer showed that the TATA box was competitive molecular for synthetic T7 promoter. It is possible that T7 promoter is bound with TF D transcription factor. The TATA box and octamer were inserted into Pvu site upstream from the T7 promoter of pT7CAT. Two recombinant plasmids, pT7TATACAT and pT7OCTCAT, were constructed and transfected into CHO cells. CAT-activity test showed that T7 promoter strength was increased by octamer factor, not by TATA box. These results suggested that T7 promoter functions as cis-acting elements of RNA polymerase transcriptional system in eucaryotic cells.
Key words: T7 promoter; cis-acting element; RNA polymerase ; Initiation of transcriptionss
T7噬菌体晚期转录系统是特殊的表达系统,其启动子为III型启动子,不能被宿主大肠杆菌
RNA聚合酶识别,只为噬菌体本身编码的T7 RNA聚合酶所识别[1]。T7启动子/T7 RNA聚合酶系统已得到较为深入的研究,并被广泛应用于基因工程中。近年又发现了T7 型启动子也能被哺乳类动物细胞转录系统所启动[2,3]。原核生物和真核生物转录系统具有明显的差异,T7启动子能为两个系统的RNA聚合酶所识别,其独特性值得注意。真核生物转录系统依赖于顺式作用因子(cis-cting element)和反式作用因子(trans-cting element)的相互作用。现已发现多种真核生物转录系统的顺式和反式作用因子,如顺式作用因子TATA框、CAAT框、GC框和八核苷酸序列(octamer)等,反式作用因子如TBP、CTF、SPl等[4]。反式作用因子通过与顺式作用因子的特异性结合启动真核生物RNA聚合酶对基因的转录。 因此顺式作用因子一般在体外具有与反式作用因子特异性形成DNA-蛋白质复合物的功能,另外真核生物顺式作用因子还具有与其他顺式作用因子一起增强或减弱转录起始的功能。T7启动子能独立地为真核生物表达系统所启动,为确定该序列作为真核生物转录系统顺式作用因子的功能,本文利用CAT基因作为报道基因和竞争性凝胶泳动技术,进一步研究了T7启动子在真核生物转录系统中的作用。
1 材料和方法
1.1 材料
质粒pT7CAT为前文[2]所构建。各种酶试剂和CAT测试盒购自Promega公司。序列测定试剂盒购自USB公司。α-鹅膏蕈碱(α-amanitin)购自BioLabs公司。BioTeZ公司合成寡聚核苷酸:T7启动子2条正负序列为T71:5′-TAATACGACTCACTATAGGGAGA-3′;T72序列为5′-CTCCCTATAGTG-GTCGTATTA-3′。TATA框2条正负链分别为TA1:5′-ATAAAA-3′;TA2:5′-TTTATA-3′。CAAT框2条正负链分别为CA1:5′-GCCAATCT-3′;CA2:5′-GATTGGCC-3′ 。GC框2条正负链GC1:5′-GGCGG-3′;GC2:5′-CGCCC-3′。八核苷酸序列2条正负链分别为OC1:5′-TTTGCAT-3′;OC2:5′-TGCAAAT-3′ 。
1.2 方法
1.2.1 常规分子生物学技术 DNA分子的体外重组,大肠杆菌DM52的转化,重组DNA分子的序列测定证实,磷酸钙朌NA沉淀法转化CHOJT细胞和HeLa细胞培养根据文献[5]提供的方法进行。
1.2.2 CAT活性检测 CAT实验主要按照文献[2,6]方法进行。106的CHO JT细胞抽提物与0.5Ci的14C-氯霉素在37℃下保温1h。点样于TLC硅胶板上,氯仿和甲醇中薄层层析分离产物,放射性自显影鉴定。其中进行α-鹅膏蕈碱敏感实验时,培养的细胞在DNA转染后,分别在不同的时间内在细胞培养液中添加10g/ml的α-鹅膏蕈碱,35h培养后收获细胞,测试CAT活性。
1.2.3 竞争性凝胶泳动实验 HeLa细胞常规培养至总量1010个,根据Andrews方法[7]制备核提取物。人工合成的T7启动子2条T71和T72寡聚核苷酸片段用γ-32P-ATP和T4多聚核苷酸激酶进行末
端标记。标记产物经Sephadex G-25柱分离纯化。常规的DNA-蛋白质结合凝胶泳动实验如下:20μl体积的反应液中含有cpm值约为5000的标记寡聚核苷酸,10μg的核抽提物,0.5μg的Poly(dI/dC),10mmol/L Tris-HC1(pH7.9),10mmol/L MgCl2,50mmol/L KCl, 1mmol/L DTT, 0.5mmol/L EDTA和5%的甘油,室温下放置30min。DNA-蛋白质复合物于5%低离子非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳,80℃真空干胶,-70℃放射自显影。进行竞争性的DNA-蛋白质结合凝胶泳动实验时,寡聚核苷酸序列除了T7启动子外,分别加入100倍(克分子数)于T7启动子的寡核苷酸序列作为DNA结合蛋白的特异性竞争性序列,其余步骤按常规的凝胶泳动实验进行。
2 结果
2.1 T7启动子为真核生物RNA聚合酶Ⅱ所识别
真核生物转录系统共有3种RNA聚合酶:RNA聚合酶(PolⅠ)、RNA聚合酶(PolⅡ)和RNA聚合酶(PolⅢ)。这些RNA聚合酶分别识别不同类型的启动子,并对α-鹅膏蕈碱表现出游同的敏感度.α-鹅膏蕈碱不影响Pol Ⅰ的启动转录活性,但对PolⅡ和Pol Ⅲ的转录起抑制作用,不过其抑制浓度不同,当α-鹅膏蕈碱浓度在1μg/ml以上时,将抑制PolⅡ的活性;α-鹅膏蕈碱浓度在100μg/ml以上时,则抑制Pol 的活性,体内和体外实验都表现出同一现象[8]。根据这一机制,将含有在T7启动子下游组装有CAT基因的pT7CAT质粒3μg转染CHO JT细胞(1×105),转染后的细胞在5h、20h、30h时分别加入10μg/ml的α-鹅膏蕈碱,各批细胞均培养35h,进行CAT实验(图1):0h和20h时加入α-鹅膏蕈碱,基本上不能检出CAT活性,30h时加入α-鹅膏蕈碱的转染细胞能检出约20%的CAT活性。10μg/ml的α-鹅膏蕈碱抑制了真核生物转录系统对T7启动子的启动作用。实验显示真核生物RNA Pol Ⅱ负责对T7启动子的转录起始。
图1α-鹅膏蕈碱对T7启动子控制的报道基因产物CAT活性影响检测
A、B、C:分别为转染细胞收获前30h、15h、和5h时加入α-鹅膏蕈碱的实验;D:转染细胞不加α-鹅膏蕈碱
Fig.1 CAT activity from T7 promoter with α-amanitin in the CHO cells A,B,C:CAT activity from the cells exposed to α-amanitin for the last 30h,15h,5h before cells harvesting,respectively;D:CAT activity fromthe cell in absence of α-amanitin
2.2 T7启动子是TBP蛋白的结合序列
真核生物RNA聚合酶识别的启始子控制mRNA的转录,此类启动子包含有多种顺式作用因子,常见的顺式作用因子有TATA框、CAAT框、GC框和八核苷酸序列。这些序列和相应转录因子结合在转录起始中起作用。T7启动子为RNA聚合酶所识别,启动报道基因的转录。为研究T7启动子与转录因子的作用,利用竞争性凝胶泳动技术(competitive electrophoretic mobility shift assay, CEMSA)来检测T7启动子作为真核生物RNA聚合酶Ⅱ顺式作用因子的功能。实验将已知相应结合蛋白的TATA框、GAAT框、GC框和八核苷酸序列(octamer)作为竞争性分子来测定T7启动子的结合蛋白因子(图2):在没有竞争性分子存在时,人工合成23bp的T7启动子,可与HeLa细胞核抽提物形成一个复合物(图2,A);当加入标记的T7启动子和未标记的TATA序列时(克分子数比例为1100)进行竞争实验时,原先的DNA-蛋白质带放射性强度大减弱(图2,B),表明TATA序列与
