刘彦君王华菁刘小萍周倩卢洋王皓卫立辛郭亚军
摘要目的: 克隆人IL-12的cDNA。方法:利用RT-PCR从人NC 37淋巴母细胞中克隆出IL-12中两个亚基p35和p40的cDNA并进行序列测定。结果:从NC 37细胞中克隆的p35 cDNA序列(GenBank登录号为AF 101062)与先前登录在GenBank上的M65271 (NC 37细胞来源)和M 65291(RPMI 8866细胞来源,美国专利号:5648467)的p35 cDNA序列分别有2处和1处碱基不同:编码第44位氨基酸残基密码子的第3个碱基M 65291是C,而M 65271和本研究AF 101062的相应序列2是G;编码第244氨基酸残基密码子的第3个碱基,M 65271序列是C,而M 65291和AF 101062的相应序列是T;编码第247氨基酸残基密码子的第2个碱基M 65271序列是C,而M 65291和AF 101062的相应序列是T。此外,本研究克隆的p40 cDNA序列与登录在GenBank的p40 cDNA (M 38444)序列完全相同。结论:尽管本研究克隆的p35 cDNA序列与已知的两种p35 cDNA序列分别有2处和1处碱基不同,但其编码的氨基酸序列却与专利登记的p35 cDNA(M 65291)编码的氨基酸序列完全一致,表明克隆的IL-12基因所表达的蛋白质在理论上是符合目前药用标准的。
关键词:白介素12cDNA聚合酶链式反应
IL-12在机体免疫调节中发挥十分重要的作用,IL-12对NK细胞和T细胞具有多重生物效应[1~3]。在动物模型中,IL-12具有明显的抗肿瘤、抗感染作用[3]。为进一步研究人IL-12在疾病治疗中的作用,我们拟克隆人IL-12中的p35和p40 cDNA。
1材料和方法
1.1材料人NC 37淋巴母细胞, 购自ATCC。本实验使用的限制性内切酶、逆转录试剂盒、抽提总RNA和mRNA的试剂盒均购自Promega公司。高忠实性PCR系统购自Boehringer Mannheim公司。细胞培养液RPMI和DMEM、胎牛血清、青霉素、链霉素均购自Gibcol BRL公司。Calcium ionophore A 23187和Phorbol 12-myristate 13-acetate购自Sigma公司。Script TMAMP SK(+) PCR试剂盒购自Strategy公司。测序反应试剂盒购自Perkin Elmer公司。测序反应产物纯化柱购自Pharmacia公司。全自动DNA测序仪系Perkin Elmer公司ABI Prism 310型。
1.2方法
1.2.1抽提NC 37细胞的mRNA将人NC 37淋巴母细胞于RPMI 1640/DMEM (1∶1)培养液中培养,其中含10%胎牛血清、25 ng/ml calcium ionophore A 23187,10 ng/ml Phorbol 12-myristate 13-acetate,100 U/ml青霉素、100 μg/ml链霉素。在37℃,7.5% CO2的孵箱中培养96 h后,取5×106个细胞;采用Promega公司的纯化总RNA和mRNA的试剂盒提取其mRNA。
1.2.2RT-PCR扩增IL-12 cDNA取0.48 μg (3 μl) 上述mRNA,8 μl 25 mmol/L的MgCl2,4 μl 10×逆转录缓冲液,4 μl 10 mmol/L dNTP,1 μl RNA酶抑制剂,1.5 μl AMV逆转录酶(37.5 U),2 μl Oligo(dT)15引物(1 μg),最后加入16.5 μl水,使终体积到40 μl。将上述混合物于48℃反应45 min,然后各取20 μl上述反应物分别做PCR以克隆IL-12中的p35和p40 cDNA。扩增p35的引物是:5′ GAC GCG GCC GCC TCG GGA CAA TTA TAA AAA TGT GG 3′和5′GAC GGT ACC GAC CTC GCT TTT TAG GAA GCA 3′ ;扩增p40的引物是:5′ GAC GGA TCC GCC CAG AGC AAG AATG TGT CAC 3′ 和5′ GAG GGA TCC TGG ATC AGA ACC TAA CTG CAG GGC 3′。PCR反应采用高忠实性PCR系统:反应体积均为80 μl,其中含上述逆转录反应物20 μl,引物各1 μl,10×PCR缓冲液6 μl及51 μl的水;在94℃热启动5 min后,加入1 μl(3.5 U)高忠实PCR酶(Taq/Pwo);PCR条件是94℃ 45 s,60℃ 1 min,72℃ 1 min,共35个循环,最后延长反应为72℃ 7 min[4]。
1.2.3PCR片段与Script TMAMP SK(+)载体的连接和转化反应取PCR-Script Cloning Vector 1 μl (10 ng/μl),10×连接缓冲液1 μl,10 mmol/L rATP 0.5μl, Srf限制性内切酶1 μl (5 U) , T4连接酶1 μl (4 U) , 最后加入纯化的PCR片段5.5 μl, 室温下孵育1 h。然后将反应物于65℃水浴10 min。随即转化感受态细菌JM 109,转化后的菌铺于含X-Gal (20 mg/ml),IPTG (200 mg/ml) 和氨苄青霉素(100 μg/ml)的LB板上。12 h后,挑选白色菌落,小样扩增后抽提质粒,酶切鉴定目的cDNA是否已经插入Script TMAMP SK(+)载体:鉴定p35用Not Ⅰ 和Kpn Ⅰ 酶,鉴定p40用Bam H Ⅰ 酶。
1.2.4p35 cDNA和p40 cDNA的序列测定将Qiagen公司Plasmid Mid Kit纯化的上述含p35和p40 cDNA的质粒,加入到Perkin Elmer公司的测序试剂中进行测序反应:分别取0.42 μg p40 cDNA-ScriptTM SK(+)质粒 (1.1 μl) 和0.42 μg p35 cDNA-ScriptTM SK(+)质粒 (2.5 μl) 作为模板,加入8 μl Terminator Ready Reaction Mix, 3.2 pmol测序引物(1 μl),加水至20 μl。p35和p40 cDNA的两端测序引物采用PCR-ScriptTM SK(+)质粒中多克隆位点两侧的通用引物T7 (5′GTA ATA CGA CTC ACT ATA GGG C 3′) 和T3(5′AAT TAA CCC TCA CTA AAG GG 3′),p35 cDNA中间测序引物序列是5′ACC AGC ACA GTG GAG GCC TGT 3′,p40 cDNA中间测序引物序列是5′GGA AGA TGG AAT TTG GTC CAC 3′。测序反应条件:96℃ 30 s;50℃ 15 s;60℃ 4 min;25个循环。利用Pharmacia公司的纯化柱纯化此测序反应物,然后将纯化后的样本通过ABI PRISM自动测序仪测序。
2结果
2.1RT-PCR扩增IL-12 cDNA的结果RT-PCR扩增产物经DNA凝胶电泳鉴定(图1),发现扩增的片段特异性强,大小与预计的长度相吻合
图 1从NC 37细胞中RT-PCR所得的
p35和p40 cDNA片段
Fig 1RT-PCR fragments of p35 and
p40 cDNA from NC 37 cells
M1 : 100 bp ladder DNA marker; M2: 1 kb DNA marker
(p40 cDNA为1 027 bp,p35 cDNA则为812 bp)。
2.2p35-Script TMAMP SK(+)和p40-Script TMAMP SK(+)阳性克隆的筛选分别从p40, p35 cDNA与Script TMAMP SK(+)连接产物转化的菌板中挑选2个和3个白色菌落。对p40-Script TM AMP SK(+) 酶切(BamH Ⅰ)显示:2个白色菌落抽提的质粒中有一个是已插入p40 cDNA的阳性质粒;对p35-Script TMAMP SK(+)质粒酶切(Kpn Ⅰ和Not Ⅰ)的结果发现:3个白色菌落抽提的质粒中有两个是已插入p35 cDNA的阳性质粒(图2)。
2.3p40和p35 cDNA的序列测定结果分别取上述1号p35 cDNA和1号p40 cDNA克隆,进行序列测定,p35 cDNA 的测序结果见图3。
图中*显示从NC 37细胞中克隆的p35 cDNA序列与登录在GenBank NC 37(M 65271)和RPMI 8866 (M 65291)细胞来源的p35 cDNA序列分别有
图 2酶切鉴定p40 cDNA/ScriptTMAMP SK(+)和p35 cDNA/ScriptTMAMP SK(+)的阳性克隆
Fig 2Identification of p40 cDNA/ScriptTMAMP SK(+) and p35 cDNA/ ScriptTM
AMP SK(+) vector by restriction enzymes
M1:500 bp ladder DNA marker; M2:100 bp ladder DNA marker
图 3p35 cDNA序列测定结果
Fig 3The result of p35 cDNA sequence
2处和1处碱基不同:编码第44位氨基酸残基密码子的第3个碱基M 65291是C,M 65271和本研究克隆的相应序列是G,所对应编码的氨基酸未变,均是缬氨酸;编码第244氨基酸残基密码子的第3个碱基,M 65271序列是C,M 65291和本研究克隆的相应序列是T,对应编码的氨基酸残基未变,均是天冬氨酸;编码第247氨基酸残基密码子的第2个碱基M 65271序列是C,对应氨基酸残基为苏氨酸,M 65291和本研究克隆的相应序列是T,对应氨基酸残基是甲硫氨酸。
总之,本研究克隆的p35 cDNA序列所编码的氨基酸序列与专利登记的p35 cDNA(美国专利号为5648467,在GenBank是M 65291)编码的氨基酸序列完全一致。针对这一结果,我们重复2次RT-PCR,从NC 37细胞的mRNA中扩增p35 cDNA片段,随后进行DNA序列测定,重复测序的结果仍与本研究第一次测定的p35 cDNA一致。本研究克隆的p40 cDNA这一序列与登录在GenBank上的p40 cDNA序列(M 38444)完全一致。
3讨论
本研究
