不论男方或女方的外生殖器发育异常或有生理上的缺陷,都能使性生活受到影响而致不孕。女性方面的先天性发育异常如处女膜闭锁、阴道横隔、阴道闭锁或狭窄都能影响性交。由于以往严重创伤形成的外阴、阴道瘢痕及狭窄也能导致性交困难而致不孕。有时外阴炎症或尿道口发炎可引起性交时疼痛而畏惧性交。也有因生理性缺陷,外阴、阴道分泌液少,使局部干燥造成性交困难,而使不孕率增高。