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用电子技术克隆基因

2022-07-30
来源:求医网

用电子技术克隆基因

在上海国际会议中心盛大的招待晚宴上,隆重地举行了第七届国际人类基因组大会论文竞赛Poster奖颁奖仪式。北京大学人类疾病基因研究中心博士后张德礼怎么也没想到能获得这一奖项。当第三次念到他的参赛论文号时,他才醒过神,快步走上主席台,在一片掌声和闪光灯中接过获奖证书,同时接受了两位国际知名专家亲笔推荐他为国际人类基因组组织成员的信函。

这次大会共审定录用了680篇会议论文参加Poster论文竞赛,其中仅有5篇论文获奖,英、美、俄、中国台湾和中国大陆各一篇。这是我国科学家首次在国际人类基因组大会上获奖。获奖的论文《人类新基因的电子克隆与实验确认》是由北京大学人类疾病基因研究中心张德礼、丁培国,国家人类基因组北方研究中心孙晓静和中国科学院生物物理研究所凌伦奖等人,在马大龙、陈润生教授指导下合作完成的。论文报告了他们电子克隆了100个人类新基因,其中23个基因已被国际基因库接收,并使用了标准化的人类基因命名符号。首批选择的10个基因经生物学实验和cDNA测序验证,确认均是真实的基因,其中半数基因是具有特定重要功能结构域的高效基因。这些与细胞增殖及分化相关癌基因和转录因子的初步克隆成功,标志着研究已取得重要阶段性成果,将来有可能开发形成产业。

据张德礼博士介绍,新基因搜寻和蛋白质功能分析是人类基因组图谱公诸于世后的研究热点,电子克隆技术以数学为核心,以计算机和互联网为工具,利用现有的表达序列标签(EST)和生物信息数据库,可以加速对人类基因组未知功能新基因的发掘,为人类功能基因组学与蛋白质组学研究提供新的线索和基础。他们建立的生物信息学分析与实验确认相结合的技术策略有助于发现更多的人类新基因,特别是其中3个人类新基因的成功克隆及其小鼠和大鼠同源基因的克隆具有理论意义,可促进新基因电子克隆软件的开发。目前,他们正在与北京大学数学学院合作建立人类新基因的自动化电子克隆软件系统,以加速我国获得一批具有自主知识产权的人类重要功能新基因。

人类基因识别工作是艰苦的,就是美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因组注释的人类新基因模式参考序列,也难免存在各种类型的错误。利用电子克隆并结合实验验证可以纠正或避免现有的人类基因组编码序列错误,这是获奖论文最突出的新发现。他们在Poster论文中举例,用确认的两个人类新基因纠正了NCBI基因组注释项目公布的3个不同类型的错误模式基因参考序列。

论文在大会展出期间受到关注,数十位科学家与张德礼博士详细讨论,特别是国外一些重要学术单位和公司代表很感兴趣,表达了与他们进一步合作的意向,俄国获奖作者与他们初步达成了共同申请中俄合作科学基金项目《人类细胞增殖分化相关癌基因和转录因子的电子克隆与功能基因组学研究》的协议。

该论文获奖还在于它正确使用公认的基因符号,促进了科学家之间的交流。由于目前世界各国都在独立进行基因研究,为了便于交流,国际人类基因组组织成立了基因命名委员会,对每个功能基因进行统一命名,以求尽快建立基因研究领域的统一语言———“世界语”,所谓世界语,是指对每个功能基因的统一命名,已被确定为新一届国际人类基因组组织的重要任务之一。

走下领奖台的张德礼博士受到我国人类基因组研究领衔人陈竺和强伯勤院士等中外著名科学家的祝贺。他们说,这奖完全是凭自己的实力得到的。

2002.05.23

路透社健康新闻