新辨识软件让调控基因现身
摘自《华文生技网》:在美国和以色列的科学家的合作之下,一种辨识、整合资料库基因形态的技术诞生了,这种技术能够锁定细胞中控制基因表现的基因。这项技术是由美国史丹佛大学、以色列的希伯来大学和威茨曼研究所共同合作开发,由史丹佛大学电脑科学教授Daphne Koller博士所带领的该研究团队已经利用这项新技术找到了许多酵母菌体内的新调控基因群落和基因,而且他们也已经经过实验证实了其中3个。
该技术所使用的第一个资料来源是基因表现,基因表现的资料原本是来自于许多不同条件下的基因微阵列资料,传统的基因微阵列实验会试验数百种不同条件而每一种条件都有数千个基因的表现。Koller博士表示:“由于每一次微阵列试验会产生数量极为庞大的资料,因此过去几年已经发展出许多电脑程式来处理这些问题。”而这项新技术也能够找到新的基因群落,不过它却是第一个整合已知和预测的调控基因资料的技术,也是第一个能同时预测哪些基因能够调控基因群落的技术。
这项技术大体说来就是让研究人员能将不同资料库的资料像乐高玩具一样组合在一起,并且将新资料依照关系性结合在一起,再进行演算,为了方便研究人员使用,该研究团队已经将这项技术——GeneXPress置于网络上免费开放。
中国生物信息
2003.05.16