什么是“全基因组鸟枪法测序”?
新华社北京12月12日电(记者 张景勇):我国科学家在世界上首次绘制出的水稻基因组“精细图”,采用的是“全基因组鸟枪法测序”,这种方法引起人们的关注,究竟何为“全基因组鸟枪法测序”?
中科院基因组信息学中心暨北京华大基因研究中心副主任于军介绍,“全基因组鸟枪法测序”也称“霰弹法”,是将基因组DNA打成小片段进行测序,然后再将这些小的片段拼接起来,重新组装成一个完整的基因组。它的最大优点是经济、快速、高效,但对高性能计算的方法和设备要求非常高。
运用“全基因组鸟枪法测序”组装成高精度全基因组的基因图,是一项技术上的新突破,在基因组研究中属首创。植物基因组有大量的重复序列,重复序列的正确识别和组装,需要开发特殊的计算软件,我国所建立的全基因组鸟枪法测序基因组组装的计算软件体系,也为开展其它重要物种的基因组研究开辟了一条全新的经济、快捷和可靠的研究方法。
解放军报网络版
2002.12.13