临床上以单纯疱疹病毒感染最多见，其次为表皮葡萄球菌、绿脓杆菌，还有少量的真菌感染和棘阿米巴感染。
患者多因感染感冒病毒、眼睑单纯疱疹病毒而并发病毒性角膜炎;真菌性角膜炎常见于有眼外伤史或长期使用抗生素和(或)激素而致菌群失调;棘阿米巴角膜炎的发生主要由于不正确的配戴角膜接触镜、接触污染的水源和角膜外伤等，因有棘阿米巴原虫黏附于角膜表面而致病。
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