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约有20%-30%的溃疡性结肠炎患者最终需要手术治疗。现在对重症患者多主张早期手术，这种治疗态度的转变，是因为目前有好几种手术可供选择和尝试，而且手术效果良好。
慢性溃疡性结肠炎的手术适应证是：
(1)急性发作：重症或暴发型病例，经“5日强力疗法“不缓解者，尤其是有穿孔、出血、中毒性白结肠者应及时手术。过占此种溃疡性结肠炎病例的死亡率高达30%。近年来，由于手术时机及治疗方法的改进，死亡率巳接近为零：
(2)慢性病变：反复发作呈慢性消耗、蛋白丢失者，儿童生长发育受限者，以及长期需用大量激素控制发作者应手术治疗。
(3)悲变：病情重，病变广泛而持续，病程长(超过7-10年)，以及幼年发病易发牛癌变者，随防期间有重度异型增生者，癌症患者均应手术治疗。
(4)其他：肠外并发症(如皮肤、关节病变)及顽固性肛门并发症(瘦管、脓肿等)久治不愈者，可考虑手术切除结肠。
结肠、直肠切除及回肠造痞，是治疗溃疡性结肠炎的主要方式，但有长期人工假肛、男性性功能障碍等弊病;回—直肠吻合术可以避免上述缺点，但除厂直肠病变较轻的病例外，一般病例术后常有直肠炎复发、恶变及吻合口瘘等病疾。
