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现在临床上使用较多的内窥镜有以下几类。
食管镜、胃镜、十二指肠镜：可以用于检查食管癌、胃癌;在十二指肠镜下做造影可检查胰腺及胆道系统癌症。在十二指肠镜下也可对胰、胆部分地区进行小型手术。
结肠镜：检查结肠肿瘤、息肉;对于早期息肉癌变可行手术治疗。
膀胱镜：检查膀肮肿瘤;并可在镜下对肿瘤进行电灼、切除等治疗。
鼻咽镜及纤维支气管镜：检查鼻咽、喉、气管及支气管的肿瘤，取活检，必要时可行激光治疗。
纵隔镜：用于检查纵隔肿瘤、肺癌及食管癌纵隔转移。
腹腔镜：用于检查腹腔内病灶范围、淋巴结转移情况，特别是检查肝癌时肝表面受累等情况。现在经皮的腹腔镜用途日益广.泛，如在腹腔镜下行胆囊取石术及胆囊切除术等。
此外，在膀肮镜下还可送入导管检查肾脏;也可经皮肤行肾穿刺到肾孟检查肾脏。
阴道镜、直肠镜、乙状结肠镜、关节镜等均在临床广泛使用。
内窥镜检查需要一定的设备及技术，应当严格掌握适应症，减少并发病。遏有可疑癌症，为得到确诊，应争取做内窥镜检查。
