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慢性结膜炎常为双侧性，有时非常顽固，久治不愈。引起本病的原因很多，常见的有感染性和非感染性两种。
感染性因素 可以是微生物导致的急性炎症迁延而成，也可是毒力较弱的病原体直接引起的慢性炎症，常见的病原有细菌(如摩-阿(Morax-Axenfeld)氏杆菌、葡萄球菌、卡他球菌、变形杆菌、大肠杆菌等)和病毒(如腺病毒等)。在眼或全身免疫力下降的个体，感染性慢性结膜炎更容易迁延不愈。
非感染性因素 与环境和生活中的众多因素有关：
1、环境中的各种理化因素，如风沙、烟尘、强光、挥发性气体等;
2、卫生条件不良、烟酒失度、睡眠不足及长期使用眼部化妆品等;
3、伴有慢性睑缘炎、屈光不正未得到矫正、泪道阻塞等;
4、长期滴用抗生素眼液、抗青光眼药物、滴眼中的防腐剂刺激等。
