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血尿要与月经、子宫出血、阴道出血或痔疮出血等污染尿液所造成的血尿相区别。
血尿要与血红蛋白尿相区别：血红蛋白尿一般呈均匀暗红色，如含大量血红蛋白时，可呈酱油样，镜检无红细胞或仅发现少数红细胞，而潜血阳性。这是一种由于先天或后天原因引起红细胞寿命缩短、过度破坏，游离血红蛋白明显增多，多余的血红蛋白自肾脏滤过，出现血红蛋白尿。
血尿要与紫质尿相区别：由于新陈代谢异常，引起的血紫质病或铅中毒，可产生大量紫质尿，紫质尿放置或经太阳晒后，尿色变为红色，棕红色或葡萄酒色，均匀或混浊，但镜下查无红细胞，尿潜血呈阴性，但尿胆原实验阳性。
血尿要与某些药物、染料试剂引起的尿颜色改变相区别：例如，口服山道年，在碱性尿中可呈红色，另外做肾功能试验的酚红，做肝功能试验的磺溴肽钠药物均可使尿呈红色，但化验尿中无红细胞，尿潜血呈阴性。
