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肠系膜上动脉急性阻塞大多数是由于栓塞所引起，原发性血栓形成较少。多因心瓣膜病、心房纤维震颤、亚急性心内膜炎、心肌梗死后心壁血管血栓形成，以及栓子脱落阻塞于肠系膜上动脉。肠系膜上动脉粥样硬化时，可因血栓形成而致阻塞。
若患者有器质性心脏病伴心房纤颤，突然发生剧烈腹痛，则应高度怀疑本病的可能，最有确诊价值的是选择性腹腔动脉造影术。
一经确诊，不论患者的情况如何，均应进行手术。大多数的学者认为早期行肠系膜上动脉切开，取出栓于是最理想的方法，不主张同时进行肠切除术(肠已坏死穿孔的例外)，其理由是：①有时很难确定肠管是否已坏死。②切除后的肠管端端吻合不可靠。③剖开取出柱子后必须继续严密观察，必要时再行剖腹探查。
若阻塞的原因是由于肠系膜上动脉粥样硬化血栓形成而致，动脉内膜剥离是很困难的，多数主张行血管旁路手术，如髂动脉、腹主动脉与肠系膜上动脉远端行搭桥术，搭桥的材料可选用人工血管或逆转的大隐静脉。
