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结核杆菌的结构比较特殊，因此造成它能够在不利的自然环境中存活。结核杆菌在低温环境中(如3℃)，可存活6- 12个月;在干痰中能存活6-8个月;若黏附于尘埃上，能保持传染性8-10天。
但它对湿热、紫外线、酒精的抵抗力弱。在液体中加热62℃- 63℃15分钟，直射日光下2小时- 3小时，75%酒精内数分钟即死亡。也就是说通过煮沸、阳光照射和酒精擦拭的方法可以有效地清除房间和附着在日用品、被服上的结核杆菌。
结核杆菌一旦进入人体后，人体的免疫系统不能完全杀灭它们。一般的细菌进入健康人的血液，人体免疫细胞能够迅速识别并将其吞噬。但进入健康人血液的结核杆菌被吞噬后，不能被融解，只能受人体的免疫力抑制，不进一步繁殖而引起发病。这时的结核杆菌是一种“休眠”状态，寄生在人体组织的细胞中。当人体免疫力下降时，处于“休眠”的结核杆菌就能够进行大量繁殖，从而引起发病。
结核杆菌可通过呼吸道、消化道和破损的皮肤黏膜进入人体，侵犯除毛发、指甲外的多种人体组织器官，引起相应器官的结核病，其中以肺结核最为常见。
