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重庆市肿瘤医院座落在风景优美的歌乐山下、嘉陵江畔，占地面积70亩。创建于1943年，时为中央卫生实验院、中央医院沙磁分院，解放后曾更名为重庆市第八人民医院、重庆市第二工人医院，1984年改建为重庆市肿瘤医院;1987年经国家科委批准成立重庆市肿瘤研究所;重庆市肿瘤防治办公室于2001年恢复，挂靠重庆市肿瘤医院。
腹部肿瘤外科
该科是集腹部肿瘤、胃肠、肛门疾病及普通外科为一体的专业科室。开展胃肠恶性肿瘤、肛肠疾病诊断及外科手术和综合治疗。其中保留外括约肌低位直肠癌根治性手术、Miles术后臀大肌带蒂肌瓣或大网膜填塞会阴腔、后盆腔脏器切除术后阴道形成修补等手术在国内外均处于先进水平。
肝胆科
由全国著名肝胆专家冉瑞图创建的第一个肝胆疾病专科。主要诊治肝、胆、胰等良、恶性疾病。开展肝胆胰脾肿瘤的手术、血管介入、微波消融、放疗、化疗及综合治疗。在肝癌的手术治疗及肝动脉、门静脉插管皮下泵留置化疗方面独具特色。利用腹腔镜治疗肝胆及胃肠道的各种手术。开展了腹腔镜脾脏、阑尾切除术、肾脏囊肿开窗引流术、肠粘连松解术、胃肠穿孔修补术、全大肠切除术及结直肠癌根治术等。
骨肿瘤科
重庆市唯一的骨肿瘤诊治中心。开展各种骨外伤、结核、炎症性骨病的诊治以及神经、肌肉、肌腱的功能重建手术;擅长各种骨肿瘤的诊断和综合治疗，尤其对骨恶性肿瘤的切除、癌细胞灭活保肢、保肢冷冻植骨、关节置换等手术有独到见地。
脑外科
开展脑和脊髓的良恶性肿瘤、颅脑外伤、血管性疾病的手术及综合治疗。擅长各种意外伤害致颅脑外伤的救治;各种脑室、脑干、脊髓良恶性肿瘤的手术切除及放化疗;脑和脊髓的血管性疾病(脑出血、动静脉畸形)的手术和介入治疗。
胸外科
主要开展食管癌、肺癌、纵隔肿瘤、胸膜、胸壁良恶性肿瘤的手术治疗及综合治疗;同时开展晚期肺癌的介入治疗、食管癌记忆合金支架植入术;利用胸腔镜辅助行肺癌、食管癌及纵隔肿瘤切除有独到之处;并承担危、急、重症病人的抢救治疗(备有ICU重症监护室)。
内科
主要治疗呼吸、心血管、消化、内分泌、神经、泌尿系统疾病等各种内科疾病。拥有呼吸机、心电监测、血糖检测仪、胰岛素泵等诊疗设备;尤其擅长急慢性心衰、心机梗塞、心率失常、高血压病、白血病、淋巴瘤、糖尿病、脑血管等疾病的治疗及抢救。
产科
该科开展产前检查、高危妊娠检查、计划生育检查和无痛人流、无痛安环、取环等计划生育手术以及不孕症治疗。设有产前培训班。开展有无痛分娩，剖宫产术后镇痛、新生儿抚触、新生儿疾病筛查、导乐式分娩，逐渐开展处女膜修补术、阴道裂伤修补、阴道紧缩术。病房设有母婴同室病房，计划生育病房。
泌尿外科
开展普通泌尿外科、男性及皮肤疾病诊治，重点开展泌尿系肿瘤的综合治疗。运用内窥镜技术行肾上腺、肾脏及膀胱、前列腺微创手术。在我市较早开展了经尿道前列腺电切术。
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