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安徽省立医院建院于1898年，前身为合肥基督医院，是一所设备先进、专科齐全、技术力量雄厚，集医疗、教学、科研、预防、保健、康复、急救为一体的省级大型综合性医院，是安徽省首批“三级甲等医院”和“全国百佳医院”。
普外科
普外科是安徽省临床医学重点学科，安徽医科大学、山东大学医学院、天津医科大学博士学位授予点，高级技术职称30人，其中博士学位者10人，3人博士在读。拥有4位博导，4个病区，6个亚专科，200余张床位，一个肝胆胰外科安徽省重点实验室。3人任中华医学会安徽省外科分会其中3个学组的组长，2人任安徽省医学会其中2个专业学会的主任委员。该科有着近30年胰十二指肠镜和胆道镜的临床经验。内镜下胰管胆管内支架置放术治疗不能切除的胰胆管恶性肿瘤、Oddis括约肌球囊扩张及切开取石术、胆道镜下取石术治疗胆道结石等居国内先进水平。腹腔镜下胃癌、结直肠癌根治术等省内领先项目。
血液科
血液科系安徽省临床重点学科，安徽医科大学、山东大学临床医学专业学位博士生培养点，安徽医科大学硕士研究生培养点，安徽省脐血干细胞移植血友病管理中心，拥有安徽省第二批“115”产业创新团队一支。该科开展急性白血病MICMb分型，微小残留病变检测，干细胞培养，脐血干细胞移植术已跻身国内先进行列。该科先后承担“八五”、“九五”、“十五”科技攻关课题，省自然科学基金课题7项，获省科学技术二等奖2项，三等奖4项，四等奖1项，多篇论文被SCI收录。
神经外科
神经外科是安徽省临床医学重点学科，博士学位授予学科，拥有安徽省第二批“115”产业创新团队一支。该科先后承担了省“七五”、“八五”攻关项目，自“九五”以来，承担了国家自然科学基金3项，安徽省“十五”科技攻关1项，安徽省自然科学基金项目3项，安徽省优秀青年科技基金项目2项，安徽省科学事业项目1项，安徽省卫生厅课题2项。该学科在国内外发表专业论著200余篇，主编《立体定向和功能性神经外科学》、《立体定向和功能性神经外科杂志》已在国内外发行15年。该科历来重视对外合作与交流，与法国、瑞典、美国和日本等世界上主要的立体定向和功能神经外科中心保持着广泛的合作和联系。是国家卫生部确定的立体定向技术培训基地和国家级医学继续教育基地，已经连续举办16届全国立体定向技术培训班，培养的医师分布在全国各地。
心脏外科
心脏外科是安徽省重点学科，硕士研究生培养点。该科开展多项心血管疾病的手术治疗，其中非体外循环下搭桥术损伤小、恢复快、费用低，尤其适合于合并其他疾病、高龄体弱的患者;在省内首家应用主动脉球囊反搏泵治疗急性严重心衰者，挽救了一批危重病人。该科至今已开展各类心脏手术近3000多例，成功率达到国内先进水平。
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