江苏肿瘤医院设置职能部门22个，设临床医学、诊断医学科室15个，基础医学研究室5个。肿瘤诊治学科齐全，专科优势突出，其中肿瘤胸外科为全国临床重点专科建设单位，全省胸部微创中心;放疗科为“135工程”重点学科，江苏省放射治疗中心;肿瘤放疗、化疗科、胸外科、头颈科为省级临床重点专科。

普通外科

1973年12月建科，有正主任医师10名，副主任医师11名，其中博士6名，硕士7名，博士生导师1名，硕士生导师2名。该科设乳腺肿瘤专业组，甲状腺肿瘤和肝胆胰脾肿瘤专业组，胃癌专业组，大肠癌专业组，泌尿生殖系肿瘤治疗组，软组织肿瘤专业治疗组;其中大肠癌专业组为省级临床重点学科，该科有2个病区，共有床位100张。

该科对于普通肿瘤“专病专治”已实施二十多年，各个专业组对各自肿瘤的治疗积累了丰富的经验，是全省普通肿瘤规范治疗的教研中心。

胸外科

省级临床重点专科。学科带头人许林、张勤、张庆震。担负着全省胸部肿瘤诊疗学术方面的带头工作及周边省疑难病人的会诊工作。主要开展食管癌、贲门癌、肺癌、纵隔胸壁肿瘤的手术治疗，年手术1100-1200例。现有高级职称14人，博士、硕士学位12人。两个病区和一个ICU病房，床位90张，拥有5台美国、德国先进呼吸机及光动力治疗仪、胸腔镜、纤维支气管镜、食管镜、血气分析仪等。

承担省科委重大课题1项、省级科研课题15项，获得省科技进步奖二等奖1项，三等奖3项，四等奖4项 ，省医学新技术引进奖15项。

有高级职称14人，中级职称8人，初级职称2人，其中博士、硕士学位12人。该科学科带头人分别在国家、省级学术机构任要职。

头颈外科

头颈外科成立于1972年，是江苏省成立最早诊治范围较全面的头颈肿瘤专科，承担了江苏省头颈肿瘤诊治、教学、科研任务，已成为江苏省和周边省市头颈肿瘤的诊治中心。目前有床位数46张，年收治头颈肿瘤病人约700余例，其中神经外科各类肿瘤近150例。主要收治口腔、涎腺、鼻腔副鼻窦、咽(鼻咽、口咽、下咽)、喉、甲状腺等部位的肿瘤，神经外科包括幕上、幕下及深部和脑干肿瘤。

共有医师15名，其中主任医师1名，副主任医师5名，主治医师4名，住院医师5名，其中硕士学位以上人员7名，硕士生导师1名，並在江苏省及南京市耳鼻咽喉头颈外科担任委员。

妇瘤外科

妇瘤外科成立于1977年。现为中华妇科肿瘤学会华东学术培训中心(江苏)、江苏抗癌协会妇科肿瘤分会主任级单位。现任科主任为中华妇科肿瘤学会委员、中国抗癌协会妇科肿瘤学会委员、中华妇科肿瘤学会华东学术培训中心副主任及江苏分中心主任、江苏省医学会妇产科分会副主任委员兼妇科肿瘤学组组长、江苏省中西医结合学会妇产科副主任委员。现有病床50余张(即将扩大至68张)，担负着江苏省以及周边地区的妇科肿瘤医师的专科培训任务，并带教妇产科妇科肿瘤专业硕士研究生。

目前开展省级科研3项、厅级重大课题1项和厅级课题1项。获厅级新技术引进奖2项。

该科医生16名，其中主任医师5名、副主任医师4名、主治医师7名;博士、硕士各3名、访美学者1名。周一至周五的专家门诊均由具有丰富临床经验的主任医师和副主任医师应诊。

内科

1973建科，是全国较早成立的肿瘤化疗专科之一。省级临床重点专科，国家药物临床试验机构，国家实体瘤内科治疗中心之一，全省肿瘤内科教育、培训和指导基地。拥有5个病区，1个层流病房，床位220余张，另设30张门诊化疗中心床位。年收治病人5800-6400人次。主要收住的肿瘤有：消化道癌(占47.3-52.3%)、肺癌(占13.4-22.5%)、乳腺癌(占10.5-11.4%)和恶性淋巴瘤(占8.1-8.8%)及其它恶性肿瘤。治疗手段齐备，采用化疗、内分泌治疗、分子靶向治疗、热疗、外周血干细胞移植及免疫调节等多种方法治疗肿瘤。在国内率先开展10余项新疗法、新技术。多人分别在国家、省级以上学术团体任职。

全科110名(医生43名、护士67名)。主任医师9名，副主任医师15名，其中包括全省知名的化疗老前辈和享受国家津贴的老专家;另有初、中级人员19名。博士3名、硕士13名，占全科人员60%以上。

放射医疗科

放射治疗科创建于1961年4月16日，是我省历史最悠久、设备最完善、规模最大的肿瘤放疗专科。该科于1995年和2001年两次被省卫生厅评为江苏省省级重点临床专科;2002年被评为江苏省135医学重点学科。处于全国领4地位的省级肿瘤放射治疗中心之一。

现有4个病区200张正式床位，另有门诊放疗的简易病床200多张。拥有国外最先进的放疗诊疗设备：3台医用高能直线加速器、1台钴机、2台模拟定位机、2台近距离后装机、2套放射治疗计划系统(TPS)，还包括开展放射物理和放射生物研究的各种仪器设备，价值共6000余万。

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