南京市中医院创建于1956年7月，是一所集医、教、研功能于一体的综合性中医医院，医院的特色专科、特色技术迅猛发展，不断创新。

肛肠科

南京市中医院肛肠科于1956年由全国首批500名老中医、前中华中医药学会肛肠分会会长丁泽民教授创建，系国家中医药管理局“十五、十一五”重点专科和全国中医肛肠重点学科，国家中医药管理局“十一五”肛肠专科协作组组长单位，江苏省重点学科，国家药物临床试验机构——中医肛肠专业，并成立南京市肛肠病医院，南京结直肠病研究所，《中西医结合结直肠病学杂志》编辑部，南京结直肠病研究所盆底疾病中心。

肿瘤科

肿瘤科成立于1993年，2002年评为南京市重点专科，2007年为江苏省重点专科。现已形成了结、直肠癌治疗中心、中西医结合癌痛治疗中心、热疗中心、贫血门诊、营养支持治疗中心等5大中心为核心的覆盖全面，特色明显的诊治体系。联合我院全国肛肠中心，发展中西医结合肠癌的专病建设，在结、直肠癌的内科诊治数量上已经位于南京市前三位，在结直肠癌的中西医结合诊治上处于省内领先水平。

脑血管病科

脑血管病科成为国家“十一五”重点专科，同时还被江苏省评为“江苏省示范中医重点专科”，“多发性脑梗死”被列为“十一五”重点专病强化建设项目。该科采用国内、外先进技术诊治脑血管病，在华东地区首家实施卒中单元，并形成独具特色的突出中医、中西医结合、针药并用、急救与康复的治疗体系。

骨伤科

骨伤科是省、市级中医重点专科。该科采用传统手法、中药内服外敷、介入、手术等手段治疗各类骨折、脊柱相关疾病、腰椎间盘突出症、颈肩腰痛等骨伤疾病有独特疗效，显现出了中医、中西医结合的治疗优势，其中激光介入治疗颈、腰椎间盘突出症居省内领先。

针灸科

针灸科是省级中医重点专科、世界卫生组织国际针灸培训中心临床基地。该科运用中医瑰宝——针灸开展了普通针灸、水针、腹针、浮针、头针、灸疗、经络整脊等疗法，治疗眩晕、肩周炎、头痛、中风、面瘫、颈椎病、腰突症、肥胖病、高脂血症、尿路感染及结石、哮喘、及神经系统、消化系统等各类疾病，诊治效果显著。

老年科

老年科是南京市中医临床重点专科建设单位 ，该科对骨质疏松症、高尿酸血症、老年性痴呆及亚健康状态、中医养生、康复等为重点的专病研究已具一定成效。特色制剂：六味骨仙饮、丹橘胶囊等。

消化科

消化科是南京市中医临床重点专科建设单位，以传统中医中药和现代医疗技术相结合治疗消化系统多发病、常见病，对各种疑难病如溃疡性结肠炎、反溃性食道炎等疗效独特，多次获市科技进步奖。

急诊科

急诊科是南京市中医临床重点专科建设单位，集120急救、急诊、抢救、ICU留观病房为一体，设有内、外、妇、儿、骨伤、五官、口腔、眼科诊室，运用中西医结合综合手段及现代化的医疗设备救治各类危急重症患者。

养生康复中心

养生康复中心以突出传统医疗优势，针对亚健康人群和特需医疗市场的需要，利用中医中药的独特优势，构建了高层次的诊疗服务平台，强调未病先治的观点和个性化服务理念为服务对象设计了独特有效的保健和治疗方案。开展药茶、药浴、按摩、推拿、理疗、药膳、名专家方剂及膏滋等康复医疗。

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