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随着益生菌类保健品的走俏，一些迷信益生菌的人甚至到处打听更“纯粹”的益生菌口服制剂。对此，医生指出，益生菌口服制剂一般只限在临床上用于治疗肠道功能衰竭或失调的病人，口服益生菌产品虽然能在短时间内使人体肠道获得有益菌，但长期服用会对人体构成潜在的危害。
医学研究证明：人体长期使用人工合成的口服益生菌产品，会造成肠道功能逐步丧失自身繁殖有益菌的能力，长此下去人体肠道便会产生依赖性，医学上称之为“益生菌依赖症”。而人体一旦患上益生菌依赖症，终生都要依靠和使用人工合成的口服益生菌产品来维持健康状态。
医生指出，人体内任何菌种都要保证一定的比例平衡，一旦失衡，即使是益生菌也会带来危害，除了产生依赖症，严重的还可引发新的感染。比如肝硬化患者，由于门脉高压致使胃肠道黏膜淤血，降低黏膜的屏障功能，胃肠内的致病菌大量繁殖，通过损伤的黏膜进入血液，会造成致命的菌血症、脓毒血症或腹膜炎。
